小数据量计算最大lyapunov代码_Software | 计算Lyapunov指数的GUI工具箱及函数包汇总...

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二十年前读书时用过的Lyapunov Exponents Toolbox,推荐给做非线性动力学入门的同学们。那个时候不会编写程序,做分支图、算连续或者离散系统的Lyapunov指数,极其困难,还好有这个工具箱,慢慢看源程序学会写一点改进的程序。所以真的很感谢有人愿意分享自己的小工具给大家。

数学中非线性动力学是个经典的领域,每年都会有学生进入到这个领域学习,煎熬的日子也会重演,所以搜集一些小工具给他们也许会很有用。

先去这里看看GUI界面的LET工具箱吧:

https://www.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/233-let?s_tid=srchtitle

Lyapunov指数工具箱(LET)为用户确定连续和离散混沌系统的Lyapunov指数和Lyapunov维数提供了一个图形用户界面。

此工具箱只能在Matlab5或更高版本的MATLAB上运行。它已经在Windows和Unix下测试过,也可以在其他平台上运行。

要运行程序,请在MATLAB命令窗口中输入LET。这个工具箱的详细描述可以在文件README.M中找到。

Cite As: 

Steve SIU (2020). 

let,MATLAB Central File Exchange. Retrieved May 21, 2020. 

https://www.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/233-let.

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如果你入门会使用它计算LE后,想自己写代码算一些个性化的系统的LE,你可以看看它的源代码,或者看看下面的纯脚本函数形式的LE计算小包,它是1985年Wolf那篇Phys D上经典文章的算法实现,也是软件包MATDS的一部分,我个人觉得很有参考价值:

Calculation Lyapunov Exponents for ODE:

https://www.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/4628-calculation-lyapunov-exponents-for-ode?s_tid=FX_rc1_behav

本函数包实现ODE系统的Lyapunov指数计算。这个m文件中用于实现Lyapunov指数的算法,该算法来源于A.Wolf、J.B.Swift、H.L.Swinney和J.A.Vastano,Physica D,1985年,第16卷,第285-317页的经典文章。

对于集成ODE系统可以使用任何MATLAB的ODE Suite。

此函数是MATDS动态系统研究工具箱的一部分。感兴趣的读者可参见: 

http://www.math.rsu.ru/mexmat/kvm/matds/

输入参数简介:

Input parameters: 

n - number of equation 

rhs_ext_fcn - handle of function with right hand side of extended ODE-system. 

This function must include RHS of ODE-system coupled with variational equation (n items of linearized systems, see Example). 

fcn_integrator - handle of ODE integrator function, for example: @ode45 

tstart - start values of independent value (time t) 

stept - step on t-variable for Gram-Schmidt renormalization procedure. 

tend - finish value of time 

ystart - start point of trajectory of ODE system. 

ioutp - step of print to MATLAB main window. ioutp==0 - no print, if ioutp>0 then each ioutp-th point will be print.

输出参数简介:

Output parameters: 

Texp - time values 

Lexp - Lyapunov exponents to each time value.

Users have to write their own ODE functions for their specified systems and use handle of this function as rhs_ext_fcn - parameter. 

样例:

Example. 

洛伦兹系统:

Lorenz system: 

dx/dt = sigma*(y - x) 

dy/dt = r*x - y - x*z 

dz/dt = x*y - b*z

雅可比矩阵:

The Jacobian of system: 

| -sigma sigma 0 | 

J = | r-z -1 -x | 

| y x -b |

变分方程:

Then, the variational equation has a form: 

F = J*Y 

where Y is a square matrix with the same dimension as J. 

相关调用的动力系统函数:

Corresponding m-file: 

function f=lorenz_ext(t,X) 

SIGMA = 10; R = 28; BETA = 8/3; 

x=X(1); y=X(2); z=X(3); 

Y= [X(4), X(7), X(10); 

X(5), X(8), X(11); 

X(6), X(9), X(12)]; 

f=zeros(9,1); 

f(1)=SIGMA*(y-x); 

f(2)=-x*z+R*x-y; 

f(3)=x*y-BETA*z; 

Jac=[-SIGMA,SIGMA,0; 

R-z,-1,-x; y, x,-BETA]; 

f(4:12)=Jac*Y;

计算执行的代码:

% Run Lyapunov exponent calculation: 

[T,Res]=lyapunov(3,@lorenz_ext,@ode45,0,0.5,200,[0 1 0],10); 

具体参见:

See files: 

lyapunov.m - algorithm 

lorenz_ext - Lorenz system extended rhs 

run_lyap - example of calling and result visualization 

此函数是MATDS动态系统研究工具箱的一部分。感兴趣的读者可参见: 

http://www.math.rsu.ru/mexmat/kvm/matds/

Cite As: 

Vasiliy Govorukhin (2020). 

Calculation Lyapunov Exponents for ODE,MATLAB Central File Exchange. Retrieved May 21, 2020.  

https://www.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/4628-calculation-lyapunov-exponents-for-ode.

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同一篇文章的算法实现,你也可以看看下面论文原作者的这个函数怎么写的:

Wolf Lyapunov exponent estimation from a time series. 

A Matlab version of the Lyapunov exponent estimation algorithm of Wolf et al. -- Physica 16D, 1985. 

by Alan Wolf 

https://www.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/48084-wolf-lyapunov-exponent-estimation-from-a-time-series?s_tid=FX_rc2_behav

在Physica 16D(1985)那篇文章中,我们提出了一种通过监测轨道发散来估计一维时间序列的主Lyapunov指数的算法。该算法是作者用Fortran和C语言编写的。现在我们把它转换成了Matlab语言。              

上述地址下载的压缩包里包括文档:Physica D文章、名为Lyapunews的pdf文件。该包包含的示例文件是以unix换行符结尾的数据点编写的。这些文件在被各种编辑器显示时可能看起来很奇怪。它可以使用任何可以输出时间序列值的软件创建数据文件,每行一个,以回车和换行结束。现有的代码可以很好地读取这些文件。如果你有问题,请不要在这里发帖,直接发邮件给作者吧。

awolf.physics@gmail.com

Cite As: 

Alan Wolf (2020). Wolf Lyapunov exponent estimation from a time series. 

https://www.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/48084-wolf-lyapunov-exponent-estimation-from-a-time-series, 

MATLAB Central File Exchange. Retrieved May 21, 2020. 

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其他方法计算LE,可以看看下面的这个Rosenstein方法:

Largest Lyapunov Exponent with Rosenstein's Algorithm 

https://www.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/38424-largest-lyapunov-exponent-with-rosenstein-s-algorithm?s_tid=FX_rc3_behav

by mirwais 

This code calculates the largest lyapunov exponent of time series with Rosenstein's Algorithm.

基于本代码做图,在图上可以看到临近轨线的发散。如果确定了轨线的线性范围,代码就可以计算出最大的lyapunov指数。代码已经用Rosenstein文章的结果进行了测试。

Cite As: 

mirwais (2020). Largest Lyapunov Exponent with Rosenstein's Algorithm 

https://www.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/38424-largest-lyapunov-exponent-with-rosenstein-s-algorithm, 

MATLAB Central File Exchange. Retrieved May 21, 2020. 

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