（1）在IDA的安装路径中找到android_server文件。

（2）将android_server拷贝到手机的/data/local/tmp目录下面。

（3） 将手机插上电脑，打开命令提示符， 
先输入”adb shell”,然后输入”su root”获取root权限。
接着输入” chmod 777 /data/local/tmp/android_server” 给android_server加上相应的权限。 
接着输入” /data/local/tmp/android_server”启动android_server。

（4）重新打开一个命令提示符，
输入”adb forward tcp:23946 tcp:23946”进行tcp端口转发

（5）adb root模式下执行” am start -D -n com.example.testjniso/com.example.testjniso.MainActivity”命令，启动所要调试的Activity。注意这里选择的Activity名的获取有个技巧可获得，先打开DDMS或者Monitor，下面的窗口日志。然后手动打开APP，在前面会提示启动的Activity名，如下图：

输入调试运行的APP后， app会弹出”Waitting for debugger”对话框,如下图所示:

               

（6）启动ida pro，点击”Debugger - > Attach -> Remote ArmLinux/Android debugger”，会看到以下对话框:

点击”Debug options”按钮，在”Suspend on process entry point”, ”Suspend on thread start/exit”, ”Suspend on library load/unload” 等选项的前面打上勾,如下图所示：

点击”ok”后会在以下对话框的hostname中填上”localhost”

在弹出的”Choose process to attach to”窗口中找到”com.example.testjniso”进程，选中该进程，然后点击”ok”按钮。

(7)打开eclipse ddms在Devices窗口中可以看到以下内容:

其中可以看到com.example.testjniso进程的端口为8700。

（8）打开命令提示符，输入以下命令：jdb -connect com.sun.jdi.SocketAttach:port=8700,hostname=localhost
   如下图所示：

(9)点击ida中的继续执行按钮，下图中的绿色三角形按钮（或者按F9）。

在ida弹出的”Add map”窗口中，一律点击”Cancle”按钮。

（10）点击app中的”点击加载so文件”按钮，确保so文件已经加载到了手机内存中。点击ida中的”Debugger -> Debugger windows -> Module list ”。在”Modules”窗口中找到libTestJni.so

点击ida中的暂停调试按钮，暂停当前的调试，如下图所示：

右击libTestJniSo.so文件，在弹出的框中点击”Jump to module base”,跳转到libTestJniSo.so文件的起始地址。

按下Alt+T，弹出查找对话框中输入” Java_com_example_testjniso_MainActivity_helloFromJni” 如下图所示：

点击”ok”按钮后，即可跳转到 Java_com_example_testjniso_MainActivity_helloFromJni 函数所在的起始地址。

然后在地址处下断点：

再按F9重新开始调试，点击app中的”点击加载so文件”按钮重新加载libTestJniSo.so，即可看到程序成功地停在了断点处：

到此处就可以正常地调试so文件了。

原文参照：http://blog.csdn.net/pengyan0812/article/details/43990791