031—pandas 读取解析实验室数据至DataFrame

前言

某个科研实验室在进行一项物理实现，实验仪器会输出一个 txt 文本的数据，研究人员需要从这个文本中将数据结构化才能进行进行统计分析。
在为个解析和分析过程中，他们选择了 Python 的 pandas 库来完成这些操作。我们今天来完成这这个 txt 数据的结构化解析。

需求：

需要将每条记录为一行数据，同时每行也包括开头的时间。

思路：

首先分析，这不是一个典型的 csv 文件，也是一个每行包含一个时间特殊值及后边紧跟一个半结构化的 json 格式。
我们需要逐行去处理，处理时用空格将每行分隔为两部分，前部分是时间，后部分为 json，这个我们可以用
pd.json_normalize() 去读取，读取时要先用 eval() 将文本转为 Python 列表对象。
读取成 DataFrame 后再追加前部分的时间列。
将每行产生的 DataFrame 循环拼接起来，就得到了最终想要的 DataFrame 数据。

二、使用步骤

读入数据

代码如下（示例）：

# 数据与需求：
# 数据存储在 txt 文件里，可 下载txt ，由于文件非常大，我们这里截取了部分。下载我们来分析一下数据的格式。
# 我们发现一行就是一条完整的数据，针对单行进行排版格式化，分析如下：
# 某行数据排版后（示意）
'''
11:21:07:320 [{"id":10670,"x":-4.86,"y":53.95,"radian":3.14,"speed":5.9,"kind":0,"position":[1, 2]},
{"id":10718,"x":3.62,"y":64.84,"radian":3.14,"speed":-0.64,"kind":0,"position":[1, 2]},
{"id":10705,"x":1.26,"y":45.85,"radian":3.14,"speed":14.89,"kind":2,"position":[1, 2]},
{"id":10534,"x":2.36,"y":31.43,"radian":3.14,"speed":-0.19,"kind":2,"position":[1, 2]}]'''
# 每行的特征有：#     开始是一个时间，然后用空格与后边的正式数据分隔
#     正式数据是一个大的列表，列表内的每个元素是一条记录
#     每条记录是一个字典，键值分别代码数据意义和数值

import pandas as pd# 用上下文管理器打开文件
with open('exp-data.txt') as f:# 定义一个空 DataFrame 来存放最终的数据df = pd.DataFrame()# 对每行进行处理，并将数据合并到 dffor line in f.readlines():# 拆分时间和记录数据time, data = line.split(' ')# 读取每行的记录，统一追加时间列df_line = pd.json_normalize(eval(data)).assign(time=time)# 将此行的数据与之前合并好的数据再合并df = pd.concat([df, df_line])
df
#关于代码逻辑可以看代码的注释。这样我们就得到了所有 DataFrame，可以再对数据进行处理分析。

在这里插入图片描述

#以下为一个性能更好的写法：
import pandas as pdwith open('exp-data.txt') as f:data_list, time_list = [], []for line in f.readlines():t, data = line.split(' ')records = eval(data)# 将所有记录存入一个列表data_list.extend(records)# 将所有记录对应的时间构造为一个列表time_list.extend([t]*len(records))# 读取数据df = pd.DataFrame(data_list)# 增加列df['time'] = time_list
df