【3D Slicer】心脏CT图像分割操作保姆级教程 Cardiac CT image segmentation

心脏CT图像分割操作流程指南

  • 1 安装3D Slicer软件
  • 2 打开文件
    • 2.1 从File->Add Data->Choose File
    • 2.2 直接拖入
  • 3 进行分割操作
  • 4 切片填充 Fill between slices
  • 5 第二个例子
  • 6 数据保存
  • 7 打开保存后的文件

1 安装3D Slicer软件

方式二选一
1.官网:3D Slicer
2.百度网盘:链接

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图片来自翩若惊鸿影DCs的博客:3D Slicer 教程01: 简介以及安装

可以按照如下七部分对心脏CT进行打标签操作:
(1)肺动脉(PA)
(2)升主动脉(AO)
(3)右心室血腔(RV)
(4)右心房血腔(RA)
(5)左心室血腔(LV)
(6)左心房血腔(LA)
(7)左心室心肌(Myo)
(根据实际情况来,仅供参考)

2 打开文件

2.1 从File->Add Data->Choose File

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2.2 直接拖入

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3 进行分割操作

1.选择Segment Editor
2.点击Add
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左侧第二排的两个笔刷都可以绘制标签

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每打完一个标签,按Enter键保存
如果打错了标签,得先按Enter键保存,再按Ctrl+Z键才能撤回
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滑动滚轴,逐个打标签。
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4 切片填充 Fill between slices

“Fill between slices” 是一个用于分割或插值医学图像中切片之间的工具。它可以帮助用户自动生成插值切片,填补图像中切片之间的空隙或缺失。
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5 第二个例子

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6 数据保存

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1.保存MRML文件(场景文件):MRML Scene(.mrml)
2.保存MRB文件(医疗现实束):Medical Reality Bundle(.mrb)
3.保存Volume(体数据):格式可为nrrd、nii、nii.gz、img等
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根据具体情况进行相应的保存
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7 打开保存后的文件

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