8个流行的Python可视化工具包，你喜欢哪个？

用 Python 创建图形的方法有很多，但是哪种方法是最好的呢？当我们做可视化之前，要先明确一些关于图像目标的问题：你是想初步了解数据的分布情况？想展示时给人们留下深刻印象？也许你想给某人展示一个内在的形象，一个中庸的形象？

本文将介绍一些常用的 Python 可视化包，包括这些包的优缺点以及分别适用于什么样的场景。这篇文章只扩展到 2D 图，为下一次讲 3D 图和商业报表（dashboard）留了一些空间，不过这次要讲的包中，许多都可以很好地支持 3D 图和商业报表。

Matplotlib、Seaborn 和 Pandas

把这三个包放在一起有几个原因：首先 Seaborn 和 Pandas 是建立在 Matplotlib 之上的，当你在用 Seaborn 或 Pandas 中的 df.plot() 时，用的其实是别人用 Matplotlib 写的代码。因此，这些图在美化方面是相似的，自定义图时用的语法也都非常相似。

当提到这些可视化工具时，我想到三个词：探索（Exploratory）、数据（Data）、分析（Analysis）。这些包都很适合第一次探索数据，但要做演示时用这些包就不够了。

Matplotlib 是比较低级的库，但它所支持的自定义程度令人难以置信（所以不要简单地将其排除在演示所用的包之外！），但还有其它更适合做展示的工具。

Matplotlib 还可以选择样式（style selection），它模拟了像 ggplot2 和 xkcd 等很流行的美化工具。下面是我用 Matplotlib 及相关工具所做的示例图：

在处理篮球队薪资数据时，我想找出薪资中位数最高的团队。为了展示结果，我将每个球队的工资用颜色标成条形图，来说明球员加入哪一支球队才能获得更好的待遇。

import seaborn as sns  
import matplotlib.pyplot as plt  color_order = ['xkcd:cerulean', 'xkcd:ocean',  'xkcd:black','xkcd:royal purple',  'xkcd:royal purple', 'xkcd:navy blue',  'xkcd:powder blue', 'xkcd:light maroon',   'xkcd:lightish blue','xkcd:navy']  sns.barplot(x=top10.Team,  y=top10.Salary,  palette=color_order).set_title('Teams with Highest Median Salary')  plt.ticklabel_format(style='sci', axis='y', scilimits=(0,0))

第二个图是回归实验残差的 Q-Q 图。这张图的主要目的是展示如何用尽量少的线条做出一张有用的图，当然也许它可能不那么美观。

import matplotlib.pyplot as plt  
import scipy.stats as stats  #model2 is a regression model  
log_resid = model2.predict(X_test)-y_test  
stats.probplot(log_resid, dist="norm", plot=plt)  
plt.title("Normal Q-Q plot")  
plt.show()

最终证明，Matplotlib 及其相关工具的效率很高，但就演示而言它们并不是最好的工具。

ggplot(2)

你可能会问，「Aaron，ggplot 是 R 中最常用的可视化包，但你不是要写 Python 的包吗？」。人们已经在 Python 中实现了 ggplot2，复制了这个包从美化到语法的一切内容。

在我看过的所有材料中，它的一切都和 ggplot2 很像，但这个包的好处是它依赖于 Pandas Python 包。不过 Pandas Python 包最近弃用了一些方法，导致 Python 版本不兼容。

如果你想在 R 中用真正的 ggplot（除了依赖关系外，它们的外观、感觉以及语法都是一样的），我在另外一篇文章中对此进行过讨论。

也就是说，如果你一定要在 Python 中用 ggplot，那你就必须要安装 0.19.2 版的 Pandas，但我建议你最好不要为了使用较低级的绘图包而降低 Pandas 的版本。

ggplot2（我觉得也包括 Python 的 ggplot）举足轻重的原因是它们用「图形语法」来构建图片。基本前提是你可以实例化图，然后分别添加不同的特征；也就是说，你可以分别对标题、坐标轴、数据点以及趋势线等进行美化。

下面是 ggplot 代码的简单示例。我们先用 ggplot 实例化图，设置美化属性和数据，然后添加点、主题以及坐标轴和标题标签。

#All Salaries  
ggplot(data=df, aes(x=season_start, y=salary, colour=team)) +  geom_point() +  theme(legend.position="none") +  labs(title = 'Salary Over Time', x='Year', y='Salary ($)')

Bokeh

Bokeh 很美。从概念上讲，Bokeh 类似于 ggplot，它们都是用图形语法来构建图片，但 Bokeh 具备可以做出专业图形和商业报表且便于使用的界面。为了说明这一点，我根据 538 Masculinity Survey 数据集写了制作直方图的代码：

import pandas as pd  
from bokeh.plotting import figure  
from bokeh.io import show  # is_masc is a one-hot encoded dataframe of responses to the question:  
# "Do you identify as masculine?"  #Dataframe Prep  
counts = is_masc.sum()  
resps = is_masc.columns  #Bokeh  
p2 = figure(title='Do You View Yourself As Masculine?',  x_axis_label='Response',  y_axis_label='Count',  x_range=list(resps))  
p2.vbar(x=resps, top=counts, width=0.6, fill_color='red', line_color='black')  
show(p2)  #Pandas  
counts.plot(kind='bar')

用 Bokeh 表示调查结果

红色的条形图表示 538 个人关于「你认为自己有男子汉气概吗？」这一问题的答案。9~14 行的 Bokeh 代码构建了优雅且专业的响应计数直方图——字体大小、y 轴刻度和格式等都很合理。

我写的代码大部分都用于标记坐标轴和标题，以及为条形图添加颜色和边框。在制作美观且表现力强的图片时，我更倾向于使用 Bokeh——它已经帮我们完成了大量美化工作。

用 Pandas 表示相同的数据

蓝色的图是上面的第 17 行代码。这两个直方图的值是一样的，但目的不同。在探索性设置中，用 Pandas 写一行代码查看数据很方便，但 Bokeh 的美化功能非常强大。

Bokeh 提供的所有便利都要在 matplotlib 中自定义，包括 x 轴标签的角度、背景线、y 轴刻度以及字体（大小、斜体、粗体）等。下图展示了一些随机趋势，其自定义程度更高：使用了图例和不同的颜色和线条。

Bokeh 还是制作交互式商业报表的绝佳工具。

Plotly

Plotly 非常强大，但用它设置和创建图形都要花费大量时间，而且都不直观。在用 Plotly 忙活了大半个上午后，我几乎什么都没做出来，干脆直接去吃饭了。我只创建了不带坐标标签的条形图，以及无法删掉线条的「散点图」。Ploty 入门时有一些要注意的点：

安装时要有 API 秘钥，还要注册，不是只用 pip 安装就可以；
Plotly 所绘制的数据和布局对象是独一无二的，但并不直观；
图片布局对我来说没有用（40 行代码毫无意义！）

但它也有优点，而且设置中的所有缺点都有相应的解决方法：

你可以在 Plotly 网站和 Python 环境中编辑图片；
支持交互式图片和商业报表；
Plotly 与 Mapbox 合作，可以自定义地图；
很有潜力绘制优秀图形。

以下是我针对这个包编写的代码：

#plot 1 - barplot  
# **note** - the layout lines do nothing and trip no errors  
data = [go.Bar(x=team_ave_df.team,  y=team_ave_df.turnovers_per_mp)]  layout = go.Layout(  title=go.layout.Title(  text='Turnovers per Minute by Team',  xref='paper',  x=0  ),  xaxis=go.layout.XAxis(  title = go.layout.xaxis.Title(  text='Team',  font=dict(  family='Courier New, monospace',  size=18,  color='#7f7f7f'  )  )  ),  yaxis=go.layout.YAxis(  title = go.layout.yaxis.Title(  text='Average Turnovers/Minute',  font=dict(  family='Courier New, monospace',  size=18,  color='#7f7f7f'  )  )  ),  autosize=True,  hovermode='closest')  py.iplot(figure_or_data=data, layout=layout, filename='jupyter-plot', sharing='public', fileopt='overwrite')  #plot 2 - attempt at a scatterplot  
data = [go.Scatter(x=player_year.minutes_played,  y=player_year.salary,  marker=go.scatter.Marker(color='red',  size=3))]  layout = go.Layout(title="test",  xaxis=dict(title='why'),  yaxis=dict(title='plotly'))  py.iplot(figure_or_data=data, layout=layout, filename='jupyter-plot2', sharing='public')  [Image: image.png]

表示不同 NBA 球队每分钟平均失误数的条形图。

外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传

表示薪水和在 NBA 的打球时间之间关系的散点图

总体来说，开箱即用的美化工具看起来很好，但我多次尝试逐字复制文档和修改坐标轴标签时却失败了。但下面的图展示了 Plotly 的潜力，以及我为什么要在它身上花好几个小时：

Plotly 页面上的一些示例图

Pygal

Pygal 的名气就不那么大了，和其它常用的绘图包一样，它也是用图形框架语法来构建图像的。由于绘图目标比较简单，因此这是一个相对简单的绘图包。使用 Pygal 非常简单：

实例化图片；
用图片目标属性格式化；
用 figure.add() 将数据添加到图片中。

我在使用 Pygal 的过程中遇到的主要问题在于图片渲染。必须要用 render_to_file 选项，然后在 web 浏览器中打开文件，才能看见我刚刚构建的东西。

最终看来这是值得的，因为图片是交互式的，有令人满意而且便于自定义的美化功能。总而言之，这个包看起来不错，但在文件的创建和渲染部分比较麻烦。

Networkx

虽然 Networkx 是基于 matplotlib 的，但它仍是图形分析和可视化的绝佳解决方案。图形和网络不是我的专业领域，但 Networkx 可以快速简便地用图形表示网络之间的连接。以下是我针对一个简单图形构建的不同的表示，以及一些从斯坦福 SNAP 下载的代码（关于绘制小型 Facebook 网络）。

我按编号（1~10）用颜色编码了每个节点，代码如下：

options = {  'node_color' : range(len(G)),  'node_size' : 300,  'width' : 1,  'with_labels' : False,  'cmap' : plt.cm.coolwarm  
}  
nx.draw(G, **options)

用于可视化上面提到的稀疏 Facebook 图形的代码如下：

import itertools  
import networkx as nx  
import matplotlib.pyplot as plt  f = open('data/facebook/1684.circles', 'r')  
circles = [line.split() for line in f]  
f.close()  network = []  
for circ in circles:  cleaned = [int(val) for val in circ[1:]]  network.append(cleaned)  G = nx.Graph()  
for v in network:  G.add_nodes_from(v)  edges = [itertools.combinations(net,2) for net in network]  for edge_group in edges:  G.add_edges_from(edge_group)  options = {  'node_color' : 'lime',  'node_size' : 3,  'width' : 1,  'with_labels' : False,  
}  
nx.draw(G, **options)