在TCGA数据下载过程中,会提示使用Download a manifest for use with the
GDC Data Transfer Toolgdc.cancer.gov实现过程:
1.下载gdc-client的压缩文件;
gdc-client_v1.4.0_Windows_x64.zip
2.将上述压缩文件copy到一个英文文件名称的文件夹内,并解压在该压缩文件名称的文件夹内;
3.将下载的manifest.txt文件复制到上述英文文件名的文件夹内;
4.在“开始”打开CMD命令符窗口,将“C:Usersmacgdc-client_v1.4.0_Windows_x64gdc-client.exe -h”复制后点击enter,查看
5.在CMD命令符窗口在此输入“C:Usersmacgdc-client_v1.4.0_Windows_x64gdc-client.exe download -m gdc_manifest_20190930_045432.txt”
即可以看到开始下载文件。可以将“C:Usersmacgdc-client_v1.4.0_Windows_x64gdc-client.exe download -m ”作为模板,下次只需要复制manifest的名字即可。
你get到了吗?
后记
但是我不得不吐槽,这个刚开始确实难用。
个人历程总结:
1.下载难 在官网为了下载gdc-client_v1.4.0_Windows_x64.zip这个文件,可是费了老劲了,下载页面一堆的说明文件,如系统要求,对于非计算机非英语母语的额,不知道是看还是不看,其实看了也白看(是不是开发者已经知道难用,所以才说明这么多)最终在下载文件时,网速很慢,几K/s的神速,以至于我都不相信它能够下载下来,前前后后一共下载了7-8次,最初就是尝试,下载不下来,就搁那了,反复研读前人的经验后又不得的老老实实去下载,终于2019-10-02晚上,我干脆开着电脑,对,就开它一夜,让它慢慢下,看什么情况。第二天,神奇出现了,竟然成功下载了两次(因为我点击了三个下载任务,两个下载成功,另外一个天亮了还在下载中---夜长,时间足,通量解决概率)。
啰里啰嗦的写了这么多,总算第一步是成功了。郁闷也开始了,哈哈
2.安装 在一个英文文件夹中解压了
3.使用 开始----CMD----输入-h,返回错误啊;
又找到网上说的修改工作环境,一通下来,一样没用郁闷啊
我咋这么难啊
4.尝试。尝试---终于好了
总之一句话,不管多难,一直不停的反复的盘它就行了!
god bless us!