uORF的含义-暂时

下面是结果文件中一些列名的详细解释:

  • ORF_ID: 预测的ORF(开放阅读框)的标识符。

  • ORF_type: 预测的ORF类型,根据其与相关CDS(编码序列)的位置进行注释。报告的ORF类别包括:

    • “annotated”: 与注释的CDS重叠,且与注释的CDS共享相同的终止密码子。
    • “uORF”: 位于注释的CDS上游,不与注释的CDS重叠。
    • “dORF”: 位于注释的CDS下游,不与注释的CDS重叠。
    • “Overlap_uORF”: 位于注释的CDS上游,并与注释的CDS重叠。
    • “Overlap_dORF”: 位于注释的CDS下游,并与注释的CDS重叠。
    • “Internal”: 注释的CDS内部的ORF,但在不同的阅读框内。
    • “novel”: 来源于非编码基因或编码基因的非编码转录本的ORF。
  • alt_ORF_type: 仅在"_collapsed.txt"文件中显示,用于报告每个ORF的替代注释,基于其在其他转录本中的相对位置(不同于最长的转录本)。

  • ORF_tstart, ORF_tstop: ORF相对于其转录本的起始和终止位置(1基准坐标)。

  • ORF_gstart, ORF_gstop: ORF在基因组中的起始和终止位置(1基准坐标)。

  • pval_frame0_vs_frame1: 帧0的P位点密度显著高于帧1的P值。

  • pval_frame0_vs_frame2: 帧0的P位点密度显著高于帧2的P值。

  • pval_combined: 通过结合pval_frame0_vs_frame1和pval_frame0_vs_frame2获得的综合P值。

  • adjusted_pval: 多重检验校正后的调整P值。

这些列名和解释有助于理解结果文件中每列的含义以及数据的具体内容。希望这些详细解释对你有帮助。

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处:http://www.mzph.cn/bicheng/41528.shtml

如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请联系多彩编程网进行投诉反馈email:809451989@qq.com,一经查实,立即删除!

相关文章

WEB安全-靶场

1 需求 2 语法 3 示例 男黑客|在线渗透测试靶场|网络安全培训基地|男黑客安全网 4 参考资料

rpc超时时间的设置对句柄和内存的影响

今天实验验证:四台拷机,配置修改入下 (1)断网 拷机时间均加快 (2)通网 拷机时间均加快 (3)断网 拷机时间均加快 另外配置超时时间为0 (4) 通网 拷机时间均加快 另外配置超时时间为0 结果分析对比: 11:30到13:36拷机分析: RPC超时时间设置为60时: 断网:…

什么是TABU搜索?

文章目录 一、说明二、什么是TABU搜索?三、如何使用禁忌搜索优化算法?四、代码解释:五、复杂度分析:六、使用禁忌搜索解决问题的示例: 一、说明 在应用博弈论完成游戏开发中,存在博弈树或图数据结构&#…

【Unity】ScreenToWorldPoint转换三维空间MousePosition

踩坑记录: 使用ScreenToWorldPoint一般会出现诸如如下代码 Camera.main.ScreenToWorldPoint(Input.mousePosition) 此时的转换,如果是2D模式下,那么直接使用即可,没有问题,因为2D中&#xff0…

ubuntu 如何查看某一个网卡的ip地址

在Ubuntu中,你可以使用多种方法来查看某一个网卡的IP地址。以下是一些常用的方法: 使用ip命令: ip命令是现代Linux系统中用于显示和操作路由、网络设备、策略路由和隧道的工具。要查看所有网络接口的IP地址,你可以使用&#xff1a…

中英双语介绍伦敦大学学院(University College London,UCL)

中文版 伦敦大学学院(UCL)简介 位置和周边环境 伦敦大学学院(University College London,简称UCL)位于英国伦敦市中心的布卢姆斯伯里(Bloomsbury)区。具体地址为: Gower Street, …

C语言 -- 扫雷游戏

C语言 – 扫雷游戏 游戏规则: 给定一个棋盘,玩家需要排查出所有隐藏的雷,也就是选择出所有不是雷的地方。 玩家选择位置,若此处有雷,玩家被炸死,游戏结束; 若此处无雷,此处提示周围一…

12.SQL注入-盲注基于时间(base on time)

SQL注入-盲注基于时间(base on time) boolian的盲注类型还有返回信息的状态,但是基于时间的盲注就什么都没有返回信息。 输入payload语句进行睡5秒中,通过开发这工具查看时间,如图所示,会在5秒钟后在执行,因此存在基于…

基于Java技术的篮球论坛系统

你好呀,我是计算机学姐码农小野!如果有相关需求,可以私信联系我。 开发语言 Java 数据库 MySQL 技术 B/S模式、Java技术 工具 Visual Studio、MySQL数据库开发工具 系统展示 首页 用户注册界面 篮球论坛界面 个人中心界面 摘要 本…

Vite: 近几个版本的更新

概述 在 2021 年 2 月,尤大正式推出了 Vite 2.0 版本,可以说是 Vite 的一个重要转折点,自此之后 Vite 的用户量发生了非常迅速的增长,很快达到了每周 100 万的 npm 下载量。同时,Vite 的社区也越来越活跃,…

机器学习原理之 -- XGboost原理详解

XGBoost(eXtreme Gradient Boosting)是近年来在数据科学和机器学习领域中广受欢迎的集成学习算法。它在多个数据科学竞赛中表现出色,被广泛应用于各种机器学习任务。本文将详细介绍XGBoost的由来、基本原理、算法细节、优缺点及应用场景。 X…

14-38 剑和诗人12 - RAG+ 思维链 ⇒ 检索增强思维(RAT)

在快速发展的 NLP 和 LLM 领域,研究人员不断探索新技术来增强这些模型的功能。其中一种备受关注的技术是检索增强生成 (RAG) 方法,它将 LLM 的生成能力与从外部来源检索相关信息的能力相结合。然而,最近一项名为检索增强思维 (RAT) 的创新通过…

Go基础知识

目标 简单介绍一下 GO 语言的诞生背景,使用场景,目前使用方案简单介绍一下 GO的使用,GO的基础语法,简单过一下一些GO的语言例子着重介绍一下GO的特性,为什么大家都使用GO语言,GO的内存结构、为什么都说GO快…

极速目标检测:算法加速的策略与实践

标题:极速目标检测:算法加速的策略与实践 目标检测算法在计算机视觉任务中扮演着重要角色,但其计算成本往往较高。优化目标检测算法的速度,不仅可以提升效率,还能使算法适用于实时系统。本文将深入探讨如何优化目标检…

【笔记】记一次在linux上通过在线安装mysql报错 CentOS 7 的官方镜像已经不再可用的解决方法+mysql配置

报错(恨恨恨恨恨恨恨!!!!!): [rootlocalhost ~]# sudo yum install mysql-server 已加载插件:fastestmirror, langpacks Determining fastest mirrors Could not retrie…

Conda Channels全掌握:Linux中添加与移除的艺术

标题:Conda Channels全掌握:Linux中添加与移除的艺术 Conda是一个流行的跨平台包管理系统,广泛用于安装和管理科学计算和数据分析软件。Conda的channels是软件包的存储库,用户可以通过添加或移除这些channels来获取所需的包。本文…

Unity中使用VectorGraphics插件时,VectorUtils.RenderSpriteToTexture2D方法返回结果错误的解决方法

Unity中使用VectorGraphics插件时,如果使用VectorUtils.BuildSprite方法创建Sprite,那么得到的Sprite往往是一个三角网格数比较多的Sprite,如果想要得到使用贴图只有两个三角面的方形Sprite,可以使用该插件提供的VectorUtils.Rend…

数据库概念题总结

1、 2、简述数据库设计过程中,每个设计阶段的任务 需求分析阶段:从现实业务中获取数据表单,报表等分析系统的数据特征,数据类型,数据约束描述系统的数据关系,数据处理要求建立系统的数据字典数据库设计…

ctfshow-web入门-文件包含(web82-web86)条件竞争实现session会话文件包含

目录 1、web82 2、web83 3、web84 4、web85 5、web86 1、web82 新增过滤点 . ,查看提示:利用 session 对话进行文件包含,通过条件竞争实现。 条件竞争这个知识点在文件上传、不死马利用与查杀这些里面也会涉及,如果大家不熟悉…

第一百四十八节 Java数据类型教程 - Java字符串搜索和Java子字符串

Java数据类型教程 - Java字符串搜索 我们可以使用indexOf()和lastIndexOf()方法获取另一个字符串中的字符或字符串的索引。例如 public class Main {public static void main(String[] args) {String str new String("Apple");int index str.indexOf("p"…