肺炎尽管很常见,但准确诊断是一项困难的任务。它要求训练有素的专家对胸部X光片进行检查,并通过临床病史,生命体征和实验室检查进行确认。肺炎通常表现为胸部X光片上一个或多个区域的阴影(opacity)增加。但是,由于肺部有许多其他状况,例如体液超负荷(肺水肿),出血,体液丢失(肺不张或塌陷),肺癌,放疗后或手术改变也会产生阴影(opacity),因此对胸部X光片肺炎进行诊断非常复杂。在肺外,胸膜腔积液(胸腔积液)也表现为胸部X光片的阴影(opacity)增加。 患者的拍片位置和吸气深度之类的许多因素可能会改变胸部X光片的外观,使解释更加复杂。临床医生因此要读取大量的图像。北美放射学会(RSNA®) 因此希望通过ML的手段自动定位肺部阴影(opacity),以便优先进行检查并加快检查速度。
本文介绍了基于深度学习yolov8的肺炎检测系统,包括训练过程和数据准备过程,同时提供了推理的代码和GUI。对准备计算机视觉相关的毕业设计的同学有着一定的帮助。
检测结果如下图:
一、安装YoloV8
yolov8官方文档:主页 - Ultralytics YOLOv8 文档
安装部分参考:官方安装教程
1、安装pytorch
根据本机是否有GPU,安装适合自己的pytorch,如果需要训练自己的模型,建议使用GPU版本。
①GPU版本的pytorch安装
对于GPU用户,安装GPU版本的pytorch,首先在cmd命令行输入nvidia-smi,查看本机的cuda版本,如下图,我的cuda版本是12.4(如果版本过低,建议升级nvidia驱动):
打开pytorch官网,选择合适的版本安装pytorch,如下图,建议使用conda安装防止cuda版本问题出现报错:
②CPU版本pytorch安装
打开pytorch官网,选择CPU版本安装pytorch,如下图:
2、安装yolov8
在命令行使用如下命令安装:
pip install ultralytics
二、数据集准备
本文数据集来自https://www.kaggle.com/c/rsna-pneumonia-detection-challenge/overview
该数据集包含5950个训练数据,662个测试数据,数据如下图:
为了使用yolov8算法进行训练,需要将该数据转换为yolov8格式,本文提供转换好的数据集下载连接:RSNA Pneumonia(RSNA肺炎)yolov8格式数据集,该数据集包含5950个训练数据,662个测试数据
三、模型配置及训练
1、数据集配置文件
创建数据集配置文件rsna_pneumonia.yaml,内容如下(将path路径替换为自己的数据集路径):
# Ultralytics YOLO 🚀, AGPL-3.0 license
# COCO 2017 dataset http://cocodataset.org by Microsoft
# Example usage: yolo train data=coco.yaml
# parent
# ├── ultralytics
# └── datasets
# └── coco ← downloads here (20.1 GB)# Train/val/test sets as 1) dir: path/to/imgs, 2) file: path/to/imgs.txt, or 3) list: [path/to/imgs1, path/to/imgs2, ..]
path: D:\DeepLearning\datasets\csdn\rsna_pneumonia_yolov8 # 替换为自己的数据集路径
train: images/train
val: images/val
test: images/test # Classes
names:0: pneumonia
2、训练模型
使用如下命令训练模型,数据配置文件路径更改为自己的路径,model根据自己的需要使用yolov8n/s/l/x版本,其他参数根据自己的需要进行设置:
yolo detect train project=rsna_pneumonia name=train exist_ok data=rsna_pneumonia/rsna_pneumonia.yaml model=yolov8n.yaml epochs=100 imgsz=640
3、验证模型
使用如下命令验证模型,相关路径根据需要修改:
yolo detect val imgsz=640 model=rsna_pneumonia/train/weights/best.pt data=rsna_pneumonia/rsna_pneumonia.yaml
精度如下:
# Ultralytics YOLOv8.1.20 🚀 Python-3.9.18 torch-2.2.0 CUDA:0 (NVIDIA GeForce RTX 3060, 12288MiB)
# YOLOv8n summary (fused): 168 layers, 3005843 parameters, 0 gradients, 8.1 GFLOPs
# val: Scanning D:\DeepLearning\datasets\csdn\rsna_pneumonia_yolov8\labels\val.cache... 607 images, 55 backgrounds, 0 corrupt: 100%|██████████| 662/662 [00:00<?, ?it/s]
# Class Images Instances Box(P R mAP50 mAP50-95): 100%|██████████| 42/42 [00:12<00:00, 3.47it/s]
# all 662 962 0.541 0.559 0.539 0.225
# Speed: 0.5ms preprocess, 7.0ms inference, 0.0ms loss, 2.5ms postprocess per image
四、推理
训练好了模型,可以使用如下代码实现推理,权重路径修改为自己的路径:
from PIL import Image
from ultralytics import YOLO# 加载预训练的YOLOv8n模型
model = YOLO('best.pt')image_path = 'test.jpg'
results = model(image_path) # 结果列表# 展示结果
for r in results:im_array = r.plot() # 绘制包含预测结果的BGR numpy数组im = Image.fromarray(im_array[..., ::-1]) # RGB PIL图像im.show() # 显示图像im.save('results.jpg') # 保存图像
五、界面开发
使用pyqt5开发gui界面,支持图片、视频、摄像头输入,支持导出到指定路径,其GUI如下图(完整GUI代码可在下方链接下载):
代码下载连接:基于yolov8的肺炎检测系统,包含训练好的权重和推理代码,GUI界面,支持图片、视频、摄像头输入,支持检测结果导出