目的
将
dcm数据格式（2D）转成nrrd数据格式（3D）
将一个文件夹下的dcm数据转成一个nrrd数据
代码
1. 安装必要包
pip install SimpleITK
2. 上代码
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Descripttion:
Result:
Author: Philo
Date: 2024-01-10 14:25:49
LastEditors: Philo
LastEditTime: 2024-01-14 20:14:56
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import SimpleITK as sitk
import osdef dicom_series_to_nrrd(input_folder, output_nrrd):# 使用SimpleITK中ImageSeriesReader类的GetGDCMSeriesFileNames方法获取指定文件夹中DICOM系列的文件名列表。dicom_names = sitk.ImageSeriesReader.GetGDCMSeriesFileNames(input_folder) # 实例化了一个ImageSeriesReader对象，它用于按顺序读取DICOM文件reader = sitk.ImageSeriesReader()# 设置了reader对象的文件名列表，以便读取DICOM信息reader.SetFileNames(dicom_names) # 调用Execute方法读取DICOM系列，将结果保存在dicom_series中dicom_series = reader.Execute() # 使用SimpleITK的WriteImage方法将dicom_series写入到指定的NRRD文件中sitk.WriteImage(dicom_series, output_nrrd)input_folder = "PAT005"
output_file = input_folder+".nrrd"
dicom_series_to_nrrd(input_folder, output_file)
