【转】DCMTK 开源库的学习笔记2:直接操作dcm文件中像素数据的尝试

转自:https://blog.csdn.net/zssureqh/article/details/8785132

DCMTK官网给出了JPEG格式压缩的DCM文件解压缩的方法(http://support.dcmtk.org/docs/mod_dcmjpeg.html),代码摘录如下:

 

DJDecoderRegistration::registerCodecs(); // register JPEG codecs
DcmFileFormat fileformat;
if (fileformat.loadFile("test_jpeg.dcm").good())
{DcmDataset *dataset = fileformat.getDataset();// decompress data set if compresseddataset->chooseRepresentation(EXS_LittleEndianExplicit, NULL);// check if everything went wellif (dataset->canWriteXfer(EXS_LittleEndianExplicit)){fileformat.saveFile("test_decompressed.dcm", EXS_LittleEndianExplicit);}
}
DJDecoderRegistration::cleanup(); // deregister JPEG codecs


通过尝试,生成的test_decompressed.dcm的传输语义TransferSyntex发生了改变,且像素数据区中的数据就代表了dcm图像中的真实像素值。利用UltraEdit等二进制编辑软件打开后一目了然:

 

原本压缩的像素数据区,被解压了出来:30 F8 30 F8 30 F8……,dcm文件中每个像素用16位来表示,采用的小端存储模式,30 F8就是十进制的-2000,即测试图像的填充背景的CT值。

博文(http://support.dcmtk.org/wiki/dcmtk/howto/accessing-compressed-data)给出了获取解压后的真实像素数据内存指针的方法,主要是的语句是:

 

        DcmElement* element = NULL;result = data->findAndGetElement(DCM_PixelData, element);if (result.bad() || element == NULL)return 1; short* pixData;result = element->getUint8Array(pixData);

此时pixData就指向了上图中的30 F8 30 F8 30 F8像素数据区的首地址。至此可以直接对dcm的像素进行操作,如下图是对其进行二值化的结果:

 

此处有一个问题未能解决:如果在对pixData指向的区域进行操作后,调用保存函数saveFile时未选择EXS_LittleEndianExplicit格式,生成的结果依然是原始图像。

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