【BME2112】w11 notes

下周做老鼠实验

  1. group analysis
    SPM group analysis
    数据地址
  2. resting state 可以分析:correlation 计算两个脑区的相关性
    静息态实验简单
  3. functional
    • 成功的实验能看到激活区
    • 不成功的实验:比如被试头动太大,不是健康的被试
  4. Spontaneous brain activity 自发性脑活动
  5. resting state FC
    头动信号很大的时候,会掩盖bold信号,呈现出相关性很大
  6. correspondence with electrophysiology
  7. resting-state networks resemble task-activated networks
  8. correspondence with anatomic connectivity 不是完全对应是相关
    胼胝体的白质纤维束,连接左右脑
    选择不同区域作为种子区域(LP,V1,HF。。。)
  9. default model network
    什么都没做的时候
    任务态信号差别一般在1%,静息态可能不到0.5%
  10. 计算脑网络的方法
    • seed-based correlation
      加一个阈值,高的区域可以单独显示出来
      如何选seed?(ppt上有4种 atlas,published coordinate, structural image, activation map)
      可以是解剖学的区域 i.e.,视皮层
      脑区边界 相关性会很sharp
    • 独立主成分分析
      activation map分解成component i.e., matlab中的gift
      ICA reveals structured nerual & artifact patterns 可以分离噪声
      传统分析都要去掉脑室,但是研究脑脊液的论文不去掉脑室
    • TE dependent
  11. graph analysis of whole brain network
    threshold 是需要试着去选取的,一开始不知道,选取效果最好的
  12. Resting-state fMRI:power but ambiguous(模糊的)
    信号的来源是很多的 除了神经信号,还有头动,呼吸等等
  13. what is noise,what is signal?
  14. 头动处理方法不同,结果也很大不同
  15. global signal 高人不那么清醒,与呼吸也相关
  16. dpabi
    sub01_1
    sub01_2
    2个session 不支持bid格式
    在这里插入图片描述

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