R语言实现多变量孟德尔随机化分析(1)

多变量孟德尔随机化分析调整了潜在混杂因素的影响。

1、调整哪些因素?参考以往文献。可以分别调整,也可以一起调整。

2、解决了什么问题?某个暴露相关的SNP,往往与某个或者某几个混杂因素相关。可以控制混杂偏倚。

3、如何解释结果?若该暴露的P值小于0.05,则可以说明该暴露独立于其他暴露对结局产生影响。否则是通过其他因素对结局产生影响。

#多变量孟德尔随机化(MVMR)
library(TwoSampleMR)
#提取多个暴露变量工具
#body mass index:ieu-b-40;
#hypertension:ebi-a-GCST90038604
#creatinine:ebi-a-GCST90025946
exposure_dat_mv<-mv_extract_exposures(c("ieu-b-40","ebi-a-GCST90038604","ebi-a-GCST90025946")) #Serum creatinine levels、Smoking initiation#提取结局信息
outcome_dat_mv<-extract_outcome_data(exposure_dat_mv$SNP,"ebi-a-GCST90013862") #colorectal cancer#整合数据
mvdat<-mv_harmonise_data(exposure_dat_mv,outcome_dat_mv,harmonise_strictness = 2)#进行MVMR的分析
res <- mv_multiple(mvdat)#提取结果
result<-res$result
#install package
# remotes::install_github("WSpiller/RMVMR",
#                         build_opts=c("--no-resave-data", "--no-manual"),
#                         build_vignettes = TRUE)
library(MVMR)
help(package="MVMR")
wer <- format_mvmr(BXGs = mvdat[["exposure_beta"]],BYG = mvdat[["outcome_beta"]],seBXGs = mvdat[["exposure_se"]],seBYG = mvdat[["outcome_se"]],RSID = rownames(mvdat[["exposure_beta"]]))
#IVW多变量孟德尔随机化结果
ivw_mvmr(wer)
#计算F值
Fz<- strength_mvmr(r_input = wer, gencov = 0)
#异质性检验
pres <- pleiotropy_mvmr(r_input = wer, gencov = 0)

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处:http://www.mzph.cn/news/147916.shtml

如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请联系多彩编程网进行投诉反馈email:809451989@qq.com,一经查实,立即删除!

相关文章

AI从入门到精通,什么是LLMs大型语言模型?

大型语言模型是指由大量文本数据训练而成的自然语言处理模型&#xff0c;它可以生成高质量的文本内容&#xff0c;并能够理解和回答人类提出的问题。 这种模型通常基于深度学习技术&#xff0c;如循环神经网络&#xff08;RNN&#xff09;或变换器&#xff08;Transformer&…

【左程云算法全讲11】贪心算法 并查集

系列综述&#xff1a; &#x1f49e;目的&#xff1a;本系列是个人整理为了秋招面试的&#xff0c;整理期间苛求每个知识点&#xff0c;平衡理解简易度与深入程度。 &#x1f970;来源&#xff1a;材料主要源于左程云算法课程进行的&#xff0c;每个知识点的修正和深入主要参考…

电子电器架构 —— 车载网关边缘节点总线转换

电子电器架构 —— 车载网关边缘节点路由转发策略 我是穿拖鞋的汉子,魔都中坚持长期主义的汽车电子工程师。 PS:小细节,本文字数3000+,详细描述了网关在车载框架中的具体性能设置。 老规矩,分享一段喜欢的文字,避免自己成为高知识低文化的工程师: 没有人关注你。也无…

Java枚举

在Java中&#xff0c;枚举&#xff08;Enumeration&#xff09;是一种特殊的数据类型&#xff0c;用于表示一组常量。Java 5及以上版本引入了枚举类型&#xff08;Enum Type&#xff09;&#xff0c;通过关键字 enum 来定义。 以下是关于Java枚举的一些基本概念和用法&#xf…

Django(八、如何开启事务、介绍长见的字段类型和参数)

文章目录 ORM事务操作开启事务 常见的字段类型和参数ORM还支持用户自定义字段类型ORM常用字段参数外键相关参数 ORM事务操作 引入事务 1.事务的四大特性原子性、一致性、隔离性、持久性 2.相关SQL关键字start transaction;rollback;commit;savapoint; 3.相关重要概念脏读、幻…

系列十、你说你做过JVM调优和参数配置,请问如何盘点JVM系统的默认值?

一、JVM的参数类型 1.1、标配参数 java -versionjava -help 1.2、XX参数 1.2.1、Boolean类型 公式&#xff1a;-XX:或者- 某个属性值 表示开启、-表示关闭 # 是否打印GC收集细节 -XX:PrintGCDetails -XX:-PrintGCDetails# 是否使用串行垃圾收集器 -XX:UseSerialGC -XX:-UseS…

使用FFmpeg合并多个ts视频文件转为mp4格式

前言 爬取完视频发现都是ts文件&#xff0c;而且都是几百KB的视频片段&#xff0c;.ts 全名叫&#xff1a;MPEG Transport Stream&#xff0c;它是一个万能的多媒体容器&#xff0c;可以装下音频、视频、字幕。有时我们需要将.ts文件转换为其他更加广泛被支持的格式&#xff0…

springboot项目中没有识别到yml文件解决办法

springboot项目中没有识别到yml文件解决办法 ![外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传] 1、这个意思就是没有配置数据库的数据源路径。所以需要配置数据源&#xff0c;比如mysql的驱动和路径。检查是否在properties或者yml文件中是否已经配置好。…

简单的用Python实现一下,采集某牙视频,多个视频翻页下载

前言 表弟自从学会了Python&#xff0c;每天一回家就搁那爬视频&#xff0c;不知道的以为是在学习&#xff0c;结果我昨天好奇看了一眼&#xff0c;好家伙&#xff0c;在那爬某牙舞蹈区&#xff0c;太过分了&#xff01; 为了防止表弟做坏事&#xff0c;我连忙找了个凳子坐下&…

图像分类(四) 全面解读复现GoogleNet_InceptionV1-V4

论文解读 InceptionV1 前言 论文题目: Going Deeper with Convolutions Googlenet论文原文地址:https://arxiv.org/pdf/1409.4842.pdf 之前看过VGG的论文&#xff08;VGG精读直达&#xff09;。当时VGG获得了 2014 ILSVRC 图像分类的第二名&#xff0c;今天来看一下第一名…

Yolov5

Yolov5 Anchor &#xff11;&#xff0e;Anchor是啥&#xff1f; anchor字面意思是锚&#xff0c;是个把船固定的东东&#xff08;上图&#xff09;&#xff0c;anchor在计算机视觉中有锚点或锚框&#xff0c;目标检测中常出现的anchor box是锚框&#xff0c;表示固定的参考框…

Mysql 三种不使用索引的情况

目录 1. 查询语句中使用LIKE关键字 例 1 2. 查询语句中使用多列索引 例 2 3. 查询语句中使用OR关键字 例 3 总结 索引可以提高查询的速度&#xff0c;但并不是使用带有索引的字段查询时&#xff0c;索引都会起作用。使用索引有几种特殊情况&#xff0c;在这些情况下&…

CSS-表格属性(1)

边框相关属性&#xff08;其他元素也能用&#xff09;&#xff1a; 属性名&#xff1a;border-style功能&#xff1a;边框风格可选值&#xff1a; 1.none 默认值(无边框) 2.solid 实线 3.dashed 虚线 4.dotted 点线 5.double 双实线 border-style: dashed; 属性名&#xff1a…

基于金鹰算法优化概率神经网络PNN的分类预测 - 附代码

基于金鹰算法优化概率神经网络PNN的分类预测 - 附代码 文章目录 基于金鹰算法优化概率神经网络PNN的分类预测 - 附代码1.PNN网络概述2.变压器故障诊街系统相关背景2.1 模型建立 3.基于金鹰优化的PNN网络5.测试结果6.参考文献7.Matlab代码 摘要&#xff1a;针对PNN神经网络的光滑…

使用Qt实现多人聊天工作室

目录 1、项目背景 2、技术分析 3、架构设计 3、1 服务器架构 3.1.1 模块划分 3.1.2 模块之间的交互 3、2 客户端架构 3.2.1 模块划分 3.2.2 模块之间交互 4、实现过程 4、1 功能实现 4.1.1 用户登录注册功能​编辑 4.1.2 用户主界面功能 4、2 设计实现 4.2.1 登录…

关于Flume-Kafka-Flume的模式进行数据采集操作

测试是否连接成功&#xff1a; 在主节点flume目录下输入命令: bin/flume-ng agent -n a1 -c conf/ -f job/file_to_kafka.conf -Dflume.root.loggerinfo,console # 这个file_to_kafka.conf文件就是我们的配置文件 然后在另一台节点输入命令进行消费数据&#xff1a; kafka-cons…

核—幂零分解

若向量空间 V \mathcal V V存在子空间 X \mathcal X X与 Y \mathcal Y Y&#xff0c;当 X Y V X ∩ Y 0 \mathcal {X\text{}Y\text{}V}\\ \mathcal {X}\cap \mathcal {Y}0 XYVX∩Y0 时称子空间 X \mathcal X X与 Y \mathcal Y Y是完备的&#xff0c;其中记为 X ⊕ Y V \ma…

SQL INSERT INTO 语句详解:插入新记录、多行插入和自增字段

SQL INSERT INTO 语句用于在表中插入新记录。 INSERT INTO 语法 可以以两种方式编写INSERT INTO语句&#xff1a; 指定要插入的列名和值&#xff1a; INSERT INTO 表名 (列1, 列2, 列3, ...) VALUES (值1, 值2, 值3, ...);如果要为表的所有列添加值&#xff0c;则无需在SQL…

每日OJ题_算法_双指针_力扣283. 移动零+力扣1089. 复写零

力扣283. 移动零 283. 移动零 - 力扣&#xff08;LeetCode&#xff09; 难度 简单 给定一个数组 nums&#xff0c;编写一个函数将所有 0 移动到数组的末尾&#xff0c;同时保持非零元素的相对顺序。 请注意 &#xff0c;必须在不复制数组的情况下原地对数组进行操作。 示例…

java每日一记 —— 第一次研究注解

注解学习的小总结 1.万事开头难&#xff1a;什么是注解2.java的注解到底有什么用&#xff1f;3.元注解3.1.Target3.2.Retention3.3.Documented3.4.Inherited3.5.Repeatable 4.自定义注解使用4.1.定义注解4.2.使用注解4.3.获取注解的类容 本篇代码在jdk11中测试通过 1.在写这篇文…