在 IntelliJ IDEA 中，工程目录（通常指的是项目的包结构或目录结构）带点和不带点的区别主要是语义上的和约定上的。这里所说的“点”通常指的是在包名或目录名中的.字符。

带点的目录结构：

当您在 IntelliJ IDEA 中看到带点的目录结构时，这通常意味着该目录结构遵循 Java 的包命名约定。例如，如果您有一个目录结构如下：

com.example.myapp
Main.java

这表示 Main.java 文件属于 com.example.myapp 包。在 Java 中，包名使用点（.）来分隔不同的命名层次，这与文件系统的目录结构是相对应的。当您在代码中引用该类时，会使用完全限定的类名，如 com.example.myapp.Main。

不带点的目录结构：

不带点的目录结构可能意味着该文件或目录不属于任何特定的包，或者它遵循了不同的组织方式。例如：

myapp
Main.java

在这种情况下，Main.java 文件不属于任何包，或者它可能属于一个默认包（通常不推荐使用默认包）。在 Java 代码中，如果没有明确指定包名，那么该类就属于默认包。

为什么使用带点的包结构？

使用带点的包结构有几个原因：

1. 组织性：它有助于组织和分类代码，使其更容易理解和维护。

2. 避免命名冲突：通过在不同的包中使用相同的类名，可以避免类名冲突。

3. 访问控制：包级别的访问控制允许您控制哪些类可以访问其他包中的类。

4. Java 生态系统：Java 的库、框架和 API 通常都使用带点的包结构，遵循这种约定有助于与这些生态系统中的其他组件集成。

总结：

在 IntelliJ IDEA 中，带点的工程目录结构通常表示遵循 Java 包命名约定的项目结构，而不带点的结构可能是非标准的或特定于项目的组织方式。使用带点的包结构是 Java 开发中的常见做法，因为它提供了代码组织、访问控制和避免命名冲突的好处。