MedSAM环境搭建推理测试

引子

之前分享过一篇SAM(感兴趣的,请移步Segment Anything(SAM)环境安装&代码调试_segment anything环境-CSDN博客)环境搭建&推理测试,虽然话说Segment Anything,但是原始模型对于一些子领域的效果还是不尽如人意的。最近医学领域的分割引起了我的注意,调研了一圈,也想看看在医学领域是否有SAM,嘿,巧了,还真被我找到了。OK,让我们开始吧。

一、安装SAM环境

docker pull cnstark/pytorch:2.0.1-py3.9.17-cuda11.8.0-ubuntu20.04

docker run -it --gpus="1" --rm -v /datas/work/zzq/:/workspace cnstark/pytorch:2.0.1-py3.9.17-cuda11.8.0-ubuntu20.04 bash

cd MedSAM

git clone GitHub - bowang-lab/MedSAM: Segment Anything in Medical Images

pip install -e . -i Simple Index

二、推理测试

1、下载模型后拷贝至work_dir/文件夹下

https://drive.google.com/drive/folders/1ETWmi4AiniJeWOt6HAsYgTjYv_fkgzoN

2、添加保存最终结果代码:

python MedSAM_Inference.py 148行 添加 plt.savefig("result.jpg")

3、测试结果如下:

三、训练

1、下载预训练模型

https://dl.fbaipublicfiles.com/segment_anything/sam_vit_b_01ec64.pth

2、下载训练集

MICCAI FLARE22 Challenge Dataset (50 Labeled Abdomen CT Scans)

3、训练

python train_one_gpu.py

4、模型转换

python utils/ckpt_convert.py

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处:http://www.mzph.cn/news/820629.shtml

如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请联系多彩编程网进行投诉反馈email:809451989@qq.com,一经查实,立即删除!

相关文章

一文详解MES、ERP、SCM、WMS、APS、SCADA、PLM、QMS、CRM、EAM及其关系

经常遇到很多系统,比如:MES、ERP、SCM、WMS、APS、SCADA、PLM、QMS、CRM、EAM,这些都是什么系统?有什么功能和作用?它们之间的关系是怎样的? 今天就一文详细分享给大家。 10大系统之间的关系 ERP 和其他…

网络层协议——IP协议

目录 IP协议 IP协议格式 分片与组装 网段划分 特殊IP地址 IP地址的数量限制 私有IP地址和公网IP地址 路由 路由表生成算法 IP协议 IP协议全称为“网际互连协议(Internet Protocol)”,IP协议是TCP/IP体系中的网络层协议。 在应用层我…

一例白加黑样本的分析

概述 这是一个典型的白加黑的恶意代码,原始样本是一个自解压文件,可能是钓鱼样本,使用了一个合法签名的exe加载一个恶意的dll,在内存中解密和运行恶意载荷,,创建启动项的方式很特别,没有传播功…

FreeRTOS_day1

1.总结keil5下载代码和编译代码需要注意的事项 下载代码前要对仿真进行设置 勾选后代码会立刻执行 勾选后会导致代码不能执行 写代码的时候要写在对应的begin和end之间,否则会被覆盖 2.总结STM32Cubemx的使用方法和需要注意的事项 ①打开软件,新建工程…

深入理解神经网络学习率(定义、影响因素、常见调参方法、关键代码实现)

目录 什么是学习率? 有哪些影响因素? 常用调整方法? 博主介绍:✌专注于前后端、机器学习、人工智能应用领域开发的优质创作者、秉着互联网精神开源贡献精神,答疑解惑、坚持优质作品共享。本人是掘金/腾讯云/阿里云等平…

基于SpringBoot+Vue的计算机课程管理平台(源码+文档+包运行)

一.系统概述 随着信息技术在管理上越来越深入而广泛的应用,管理信息系统的实施在技术上已逐步成熟。本文介绍了基于工程教育认证的计算机课程管理平台的开发全过程。通过分析基于工程教育认证的计算机课程管理平台管理的不足,创建了一个计算机管理基于工…

第八届云计算与大数据计算国际会议(ICCBDC 2024)即将召开!

第八届云计算与大数据计算国际会议(ICCBDC 2024)将于2024年8月15-17日在英国的牛津布鲁克斯大学举行。云舞长空,数织经纬,ICCBDC 2024将围绕推动云计算与大数据技术的创新与发展,促进全球范围内的学术交流与合作,共同探索云计算与…

linux项目部署 解决Nginx浏览器刷新出现404,但是不刷新是能够正常请求成功

文章目录 目录 文章目录 安装流程 小结 概要安装流程技术细节小结 概要 提示:部署成功,访问登录页面登录也成功,强制刷新浏览器报404问题 进入到系统 刷新页面 解决流程 参考如图,再下面添加这条配置信息 location / {try_file…

短信sms接口文档

短信SMS接口文档 1. 用户相关1.1 获取用户余额请求请求参数响应Json响应示例 2. 短信模板2.1 添加请求请求参数响应Json响应示例 2.2 修改请求请求参数响应Json响应示例 2.3 列表请求请求参数响应Json响应示例2.4 删除请求请求参数响应Json响应示例 3. 短信签名3.1 添加请求请求…

说说你对集合的理解?常见的操作有哪些?

一、是什么 集合(Set),指具有某种特定性质的事物的总体,里面的每一项内容称作元素 在数学中,我们经常会遇到集合的概念: 有限集合:例如一个班集所有的同学构成的集合无限集合:例如…

《LeetCode力扣练习》代码随想录——二叉树(把二叉搜索树转换为累加树---Java)

《LeetCode力扣练习》代码随想录——二叉树(把二叉搜索树转换为累加树—Java) 刷题思路来源于 代码随想录 538. 把二叉搜索树转换为累加树 递归-中序遍历 /*** Definition for a binary tree node.* public class TreeNode {* int val;* TreeNode left;*…

探索Python爬虫技术:高效获取网络数据

探索Python爬虫技术:高效获取网络数据 在当今这个信息爆炸的时代,数据成为了企业和个人决策的重要依据。而Python爬虫技术,作为获取网络数据的一种手段,已经成为了许多数据分析师、开发者和研究者必备的技能。本文将为您详细介绍P…

LangChain入门:19.探索结构化工具对话

引言 在人工智能的浪潮中,对话代理技术正逐渐成为企业和开发者关注的焦点。LangChain,作为对话代理领域的一颗新星,自2021年9月诞生以来,以其强大的功能和灵活的应用场景迅速赢得了市场的认可。本文将带你深入了解LangChain中的S…

智慧公厕厂家,众多智慧公厕精品工程解读

智慧公厕,作为现代城市建设中的重要组成部分,正以其智能化、信息化的特点逐渐引起人们的关注。 一、什么是智慧公厕? 智慧公厕是什么?智慧公厕通过物联网、大数据、云计算、网络通信、自动化控制等技术,监测公厕内部…

深度学习知识点:卷积神经网络(CNN)

深度学习知识点:卷积神经网络(CNN) 前言卷积神经网络(CNN)卷积神经网络的结构Keras搭建CNN经典网络分类LeNetAlexNetAlexNet 对比LeNet 的优势? VGGVGG使用2个33卷积的优势在哪里?每层卷积是否只…

pip如何查看Python某个包已发行所有版本号?

以matplotlib包为例子, pip install matplotlib6666 6666只是胡乱输入的一个数,反正输入任意一个不像版本号的数字都可以~ matplotlib所有版本号如下, 0.86, 0.86.1, 0.86.2, 0.91.0, 0.91.1, 1.0.1, 1.1.0, 1.1.1, 1.2.0, 1.2.1…

Python深度学习:【模型系列】 Transformer模型有哪些著名的变种

Transformer模型自从2017年由Google的研究者引入以来,已经演化出许多重要和有影响力的变体。这些变种模型在不同的任务和领域中被广泛使用,包括自然语言处理、计算机视觉和多模态学习。以下是一些最著名的Transformer变体: BERT (Bidirectional Encoder Representations fro…

Backtring整理

Letter Combinations of a Phone Number - LeetCode 子集问题,从多重循环到回溯 用一个path记录 回溯三问: dfs(i)->dfs(i 1) 这题要注意idx是我们遍历的数字的位数,backtracking的时候要到下一层就是下一个数字,每个数字…

Web前端开发——Ajax,Axios概述及在Vue框架中的使用

前言: 整理下学习笔记,打好基础,daydayup!!! Ajax Ajax是什么? Ajax全称Asynchromous JavaScript And Xml,是异步的JavaScript和Xml。 Ajax的作用? 1,数据交换:通过Ajax可以给服务器…

Python统计分析库之statsmodels使用详解

概要 Python statsmodels是一个强大的统计分析库,提供了丰富的统计模型和数据处理功能,可用于数据分析、预测建模等多个领域。本文将介绍statsmodels库的安装、特性、基本功能、高级功能、实际应用场景等方面。 安装 安装statsmodels库非常简单,可以使用pip命令进行安装:…