r 安装源码包安装本地r包

总结一下手动安装R包 - 简书 (jianshu.com)https://www.jianshu.com/p/2a7a36414734


#BiocManager::install("simplifyEnrichment")
#BiocManager::install("EnsDb.Hsapiens.v86")#下载包 之后 手动安装
#install.packages("~/datasets/EnsDb.Hsapiens.v86_2.99.0.tar.gz", repos = NULL, type = "source")#remotes::install_github("HaojiaWu/plot1cell",dependencies = TRUE)
library(plot1cell)

在R语言上安装R包的时候，总是会遇到安装报错，其实很多时候都是因为R语言版本和R包版本不匹配导致的，这时候就需要自己手动安装R包了，查了好多网页文章，方法很多很杂，现在来总结一下。

无论哪种方法都需要自己先去R包官网找到自己想下载的R包版本的链接
R官网链接：
https://www.r-project.org
选择离自己近的镜像：https://mirrors.tongji.edu.cn/CRAN/
找到Packages -> Table of available packages, sorted by name

第一种方法：
将R包下载到本地，然后去R里面安装
参考链接：
https://blog.csdn.net/weixin_30832143/article/details/94986731

setwd("F:\\CNV\\Paper\\Case-control\\mHMM")#设置本地路径
install.packages("mHMM_1.0.zip",repos=NULL)#安装

这种小白不太喜欢，界面换来换去很麻烦。

第二种方法：
非常推荐，直接在R里面下载安装R包。小白一开始不知道R里面也能下载软件，都是自己默默地手动下载，蠢哭，委屈 ╮（╯＿╰）╭。
感谢这位朋友，文章链接：
https://zhuanlan.zhihu.com/p/129331377

download.file("https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/amap/amap_0.6.tar.gz","amap_0.6.tar.gz")#下载R包
install.packages("amap_0.6.tar.gz",repos=NULL)#安装

第三种方法：
喜欢使用终端的可以用，在终端用shell命令下载R包，然后安装。
缺点是需要知道R包的library库的绝对路径，对于刚起步的小白来说要求有点高，嘤嘤嘤〒▽〒。
其实安装软件的返回报告结果中有R包的library库绝对路径。

install.packages("stringi")

正在上传…重新上传取消

安装报告

知道绝对路径后在终端用shell命令下载R包进行编译

wget -c https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/stringi/stringi_1.0-1.tar.gz#下载R包
R CMD INSTALL -l  /path/to/your/library  /path/to/your/downloaded/package #编译

第四种方法：
如果用个人电脑，有R界面的话，其实可以界面化操作,可视化手动安装R包，比较傻瓜，适合比小白还小白的行外的朋友啦。我这里展示的是mac os 系统的，windows应该也差不多的。
打开R -> Packages & Data -> Package Installer