python医学图像分割_基于cv2的医学图像分割

例如,图像如下所示:import cv2

import numpy as np

img = cv2.imread("mdb168.pgm",0)

import matplotlib.pyplot as plt

plt.imshow(img, cmap="gray")

56a28aeed3f1b7e309828100f26f22d4.png

我想删除图像中所有的伪影和不必要的部分。在

为此,我首先对图像进行二值化

^{pr2}$

eedc72b748d8b38f64a76e3f106b5d38.png

使用开口kernel = np.ones((20,20),np.uint8)

opening = cv2.morphologyEx(thresh1, cv2.MORPH_OPEN, kernel)

plt.imshow(opening, cmap="gray")

C0cj6.png

然后是侵蚀kernel = np.ones((120,120),np.uint8)

erosion = cv2.erode(opening,kernel,iterations = 1)

plt.imshow(erosion, cmap="gray")

9e63e23b1aa2b73f24d4ff980458514e.png

然后将此蒙版与原始图像合并merged = cv2.bitwise_and(img, img , mask=erosion)

plt.imshow(merged, cmap="gray")

7aa076f4ff95efbce294827682d39bb8.png

我现在要切除左上角的胸肌。

在本出版物中:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26742491

它们使用完全相同的数据集,并使用“种子区域生长”来实现这一点。

但是,没有提供代码,我在opencv中找不到这个。在

我可以通过再做扩张/腐蚀等来达到类似的效果,但我正在寻找一个更具普遍性的解决方案。

另外,有些图像没有显示肌肉,这也应该被检测到。在

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