我也碰到了这个问题，用brew升级python的时候忘记了备份，升级之后才发现pip也不能正常工作了，不过幸好找到了解决方法，重新安装几百兆的package实在是不能忍……

先将虚拟环境中的部分文件删除

cd

rm .Python

rm bin/pip{,2,2.7}

rm bin/python{,2,2.7}

rm -r include/python2.7

rm lib/python2.7/*

rm -r lib/python2.7/distutils

rm lib/python2.7/site-packages/easy_install.*

rm -r lib/python2.7/site-packages/pip

rm -r lib/python2.7/site-packages/pip-*.dist-info

rm -r lib/python2.7/site-packages/setuptools

rm -r lib/python2.7/site-packages/setuptools-*.dist-info

删除之后，再建立一次虚拟环境，目录还是用原来的目录

virtualenv