对付Linux的问题，其实很多都是权限问题，细心想一下即可。
centos6.4默认装的是mysql5.1，使用 yum update 也update不了。google了一下，找到个yum安装的方法：http://www.webtatic.com/packages/mysql55/
先备份一下：（非常重要）
- 备份数据库文件： 复制 /var/lib/mysql/下的数据库文件到安全的目录 （复制回来的时候注意修改权限 ）
cp -r /var/lib/mysql /home/www/bak/mysql/ 再把这个目录清空了（mysql启动的时候会重新加载数据库文件）
- 备份mysql数据库用户文件：mysql内置的用户，root等也需要我们去备份。（这里我遇到了问题，存储过程也得备份，不知道为什么文件中没有保存这些信息）。
mysqldump -u username -p --database mysql > /home/www/bak/mysqluser.sql
再将 /etc/my.cnf 备份一下，cp一下即可。
下面开始升级：
- 加个yum的源：
rpm -Uvh http://mirror.webtatic.com/yum/el6/latest.rpm
国外的童鞋弄d~~~
- 装个replace的软件，这个非常方便，省去了我们自己去卸载mysql的步骤
yum install mysql.`uname -i` yum-plugin-replace yum replace mysql --replace-with mysql55
- 安装mysql5.5 ，再启动一下；这个时候启动应该是有很多提示。所以用safe install来启动
yum install mysql55 mysql55-server
mysql_secure_installation - 装好后开始导入原来的数据。
cp -rf /home/www/bak/mysql/* /var/lib/mysql/
chown -R mysql.mysql /var/lib/mysql这里cp命令默认是加了 -i参数的，可以在 ~/.bashrc里面去掉注释，然后 source ~/.bashrc 使用改动生效 ， 再将文件权限所有者改回mysql（非常重要！）
- 导入原来的用户sql文件
mysql < /home/www/bak/mysqluser.sql
重启一下Mysql即可。
在整个系统升级的过程中，遇到很多问题，包括nginx的问题，phpMyAdmin没法登录，Thinkphp没法登录等问题，原因是php的session没法写。找到原因是升级的过程中，apache也升级了，session目录的所有者是apache。改为Nginx后问题解决...
这里有个问题，恢复过程中，存储过程没了？！还是整个数据库都 dump了出来，再导入恢复。就是不明白为什么数据库文件包含了视图，却没有存储过程和函数呢？
分析一下, ibdata1保持的是所有 Innodb 的数据库文件，.frm,.xxx这些文件保存的是各自的数据库文件...
还有一篇参考文章，手把手教学：http://www.ovaistariq.net/490/a-step-by-step-guide-to-upgrading-to-mysql-5-5/
