因预处理医学图像数据需要用到以下的Python库
SimpleITK；Anaconda；PIL (Python Imaging Library)，故重新安装Python和第三方库。
一、安装Python

去官网：https://www.python.org/downloads/ 下载相应版本。
双击下载的安装包，安装过程需要注意修改添加程序到环境变量。

二、 Anaconda科学计算包

Python是一种强大的编程语言，其提供了很多用于科学计算的模块，常见的包括numpy、scipy和matplotlib。
要利用Python进行科学计算，就需要一一安装所需的模块，而这些模块可能又依赖于其它的软件包或库，因而安装和使用起来相对麻烦。
幸好有人专门在做这一类事情，将科学计算所需要的模块都编译好，然后打包以发行版的形式供用户使用，Anaconda就是其中一个常用的科学计算发行版。
同类的还有Python(x,y)、Canopy，相较而言还是比较推荐Anaconda。当然Anaconda除了集成常用的包外，它也拥有spyder IDE、IPython、Jupyter Notebook，可以满足你多种使用环境提高便利性。
1.下载Anaconda

地址：https://www.continuum.io/downloads

根据版本选择合适的安装包，需要注意的是，如果前面装了python需要卸载掉，因为Anaconda自带python环境，同样的也分Python2.x和Python3.x，这里我们选择Python3.5。

2.安装Anaconda

注意这里选择Just Me，否则可能导致快捷启动找不到程序。

如果你已经安装好Anaconda，恭喜你可以省掉很多安装第三方库的时间。

三、使用建议

如果你不怕折腾可以使用Python官方安装包自行安装第三方库，再使用sublime文本便捷器来写入代码；如果你对计算机不是特别了解则推荐安装Anaconda可以省掉很多不必要的麻烦，再搭配Pycharm使用即可。

四、 第三方库的安装及卸载

python中，安装第三方模块，是通过管理工具pip完成的。
可使用已经安装好的Anaconda去安装第三方库(SimpleITK)

运行打开 Anaconda Prompt
pip install SimpleITK 

安装常用的Python Imaging Library（PIL），这是Python下非常强大的处理图像的工具库。不过，PIL目前只支持到Python 2.7，并且有年头没有更新了，因此，基于PIL的Pillow项目开发非常活跃，并且支持最新的Python 3。
因此，安装Pillow的命令就是

pip install Pillow

有了Pillow，处理图片易如反掌。随便找个图片生成缩略图：

>>> from PIL import Image
>>> im = Image.open('test.png')
>>> print(im.format, im.size, im.mode)
PNG (400, 300) RGB
>>> im.thumbnail((200, 100))
>>> im.save('thumb.jpg', 'JPEG')

卸载第三方库

pip uninstall SimpleITK

参考主页

http://www.jianshu.com/p/0bd0bc73eff2
http://www.liaoxuefeng.com/wiki/0014316089557264a6b348958f449949df42a6d3a2e542c000/00143186362353505516c5d4e38456fb225c18cc5b54ffb000