【Python库安装】Python环境安装景观模式分析常用库PyLandStats
- PyLandStats 简介
- 景观分割
- 景观指标
- PyLandStats 安装
- 参考
PyLandStats 简介
PyLandStats 是一个用于景观模式分析的 Python 库。它允许用户计算景观格局的各种统计量和指标,广泛应用于生态学、地理信息科学和城市规划等领域。PyLandStats 能够帮助研究人员和从业者分析景观的空间结构,并量化景观的复杂性和多样性。
主要功能包括:
- 景观分割:将景观划分为不同类型的地块(patches)。
- 景观指标:提供多种景观指标(如斑块数量、斑块面积、边缘密度、形状指数等),帮助用户了解景观结构。
- 景观可视化:支持简单的可视化,帮助用户更直观地理解景观数据。
PyLandStats 通常用于分析栅格化(rasterized)的地理数据,特别是对土地覆盖变化以及景观破碎化的研究。
景观分割
景观分割(Landscape Segmentation)的原理是将景观划分为不同的空间单元(通常称为斑块,patches),每个单元具有相对一致的土地覆盖类型或其他属性。这种划分有助于分析景观的空间结构,评估景观的破碎化、连通性等特性。景观分割是景观生态学、土地利用分析和城市规划中的一个重要步骤,它为后续的景观指标计算和模式分析提供了基础。
景观分割的具体原理可以根据以下几个方面解释:
1、栅格数据和分类
大多数景观分割基于栅格(Raster)数据进行。栅格数据由一个规则的网格组成,每个网格单元(即像素)代表一个空间单位,并包含某种属性值(例如土地覆盖类型)。这些属性值可能是:
- 土地覆盖类型:如城市区域、森林、草地、农田等。
- 植被指数:如归一化植被指数(NDVI),表示植被密度。
- 不透水面比例:如城市化过程中建筑物和道路覆盖的比例。
景观分割的第一步通常是基于这些属性将景观进行分类。分类可以通过监督分类或无监督分类的遥感技术完成。
- 监督分类:使用已知的训练数据(如标记好的地块样本)进行分类。
- 无监督分类:通过聚类算法(如 K-means)自动将像素分组为不同类别。
2、连通性原则
景观分割的另一个关键原则是空间连通性,即将空间上相邻且具有相同属性(如相同土地覆盖类型)的像素聚合在一起,形成斑块。
- 4-邻接:每个像素与其上下左右的四个像素相连,若这些像素具有相同的属性,则它们被划分为同一个斑块。
- 8-邻接:每个像素与其周围的八个像素(包括对角线方向)相连,属性相同的像素被归为同一斑块。
连通性原则帮助识别出景观中具有空间一致性的区域,并将其划分为斑块。
3、斑块的定义
在景观分割中,一个**斑块(Patch)**是指在空间上相连的、具有相同或相似属性的像素群体。斑块的概念是景观生态学中的核心概念之一,它代表了景观中的基本空间单元。
- 均质性:每个斑块内部的像素具有相同的土地覆盖类型或其他属性。
- 边界:斑块的边界通常由不同类型的像素分界。
- 形状和大小:斑块的形状和大小可以有很大差异,取决于景观的特征和分割的尺度。
4、尺度和分辨率
景观分割的结果对空间尺度和分辨率非常敏感。分辨率越高(像素越小),景观分割会产生更多的小斑块;而在低分辨率下,斑块可能会更大、更少。
- 空间分辨率:指栅格数据中每个像素所代表的实际地理面积。例如,30米分辨率意味着每个像素代表30米×30米的区域。
- 尺度依赖性:景观的空间模式在不同的尺度上可能会有所不同。因此,景观分割时需要根据研究目的选择合适的尺度。
景观指标
PyLandStats 库可以计算多种景观指标,这些指标可用于分析景观的空间结构、组成和形态。它们通常用于评估景观的破碎化、斑块(patches)特征和整体景观多样性。
在 PyLandStats 中,景观指标大致分为以下几类:
- 斑块级别(Patch Level Metrics):计算单个斑块的特征指标。
- 分类级别(Class Level Metrics):按景观中的每种土地覆盖类型分类进行计算。
- 景观级别(Landscape Level Metrics):计算整个景观的综合指标。
1、斑块级别指标: 斑块级别指标描述了景观中每个独立斑块的特征。这些指标通常用于评估特定类型土地覆盖的空间模式。
- 斑块面积(Patch Area):每个斑块的面积。
- 斑块周长(Patch Perimeter):每个斑块的周长。
- 形状指数(Shape Index):衡量斑块形状的复杂性,越高的值表示斑块的形状越复杂。
- 斑块边缘密度(Edge Density):每个斑块的边缘长度与面积的比值。
- 周长面积比(Perimeter-Area Ratio):斑块的周长与面积之比,反映斑块的形状特征。
2、分类级别指标: 分类级别指标是按每种土地覆盖类型计算的,通常用于分析某一类斑块(如森林、城市区域)的整体特征。
- 斑块数量(Number of Patches, NP):特定类型的斑块总数,表示该类型的破碎化程度。
- 平均斑块面积(Mean Patch Area, MPA):该类型中所有斑块的平均面积。
- 最大斑块面积(Largest Patch Index, LPI):该类型中最大的斑块占整个景观的比例。
- 斑块密度(Patch Density, PD):每单位面积内某一类别的斑块数量。
- 边缘密度(Edge Density, ED):某一类别的所有斑块的边缘总长度除以景观面积,表示边缘化程度。
- 形状指数(Shape Index, MSI):该类别斑块的平均形状复杂度。
- 聚合指数(Aggregation Index, AI):反映同类斑块之间的聚合程度,数值越高表示斑块更聚集。
3、景观级别指标
景观级别指标用于描述整个景观的总体特征。这类指标可用于比较不同景观的复杂程度和多样性。
- 景观多样性指数(Shannon Diversity Index, SHDI):评价景观的多样性,数值越高表示景观中的土地覆盖类型越丰富。
- 景观均匀度指数(Shannon Evenness Index, SHEI):衡量景观中各土地覆盖类型的均匀度,数值越接近 1 表示各类型的比例越均匀。
- 景观破碎化指数(Landscape Division Index, DIVI):衡量景观的破碎化程度,数值越高表示景观越破碎。
- 景观形状指数(Landscape Shape Index, LSI):反映景观的总体形状复杂度,数值越高表示景观中斑块的形状越复杂。
- 斑块密度和边缘密度(Patch and Edge Density, PD and ED):计算整个景观中斑块的密度和边缘密度。
- 斑块总数(Total Number of Patches, TNP):整个景观中所有斑块的数量。
- 总边缘长度(Total Edge, TE):整个景观中所有斑块的边缘总长度。
4、空间分布指标
除了上述标准的指标,PyLandStats 也能计算一些反映景观空间分布特征的指标:
- 平均最近邻距离(Mean Nearest Neighbor, MNN):计算每个斑块到最近邻斑块的距离,反映斑块的空间分散程度。
- 聚集度(Clumpiness Index, CLUMPY):衡量同类斑块是否聚集在一起,数值越高表示聚集程度越高。
- 邻域矩阵(Proximity Index, PROX):计算斑块之间的相对接近度,考虑了斑块的大小和位置。
PyLandStats 安装
1、使用 pip 安装
PyLandStats 可以通过 pip 安装,这是 Python 包管理器中常用的命令。
pip install pylandstats
PyLandStats 依赖于一些常用的库,如 numpy、pandas、matplotlib、scipy 和 rasterio 等。如果使用 pip 安装,依赖库通常会自动安装。
2、使用 conda 安装(暂未可行)
由于 PyLandStats 尚未托管在 Conda 的官方或社区渠道中,仍需使用 pip 安装它。
conda info --envs
conda activate myenv3.8