Day 1!
前期已经成功挑战了很多期NHANES啦!打算来试试孟德尔随机化领域~
随着孟德尔随机化研究的普及,现在孟德尔发文的难度越来越高,简单的双样本想被接收更是难上加难,那么如何破除这个困境,这次我打算做组学孟德尔-脂质体组学~
想做的师弟师妹们也可以跟着一起做起来!
挑战5天完成一篇孟德尔随机化脂质体组学SCI!
今天的主要任务就是初步检索+确定目标期刊和文献。
不同类型文章的操作步骤都类似,首先得检索你的idea是否已经被他人做过,这特别特别特别重要!!!我对“liposome and mendelian randomization”进行了检索,截至才发文了12篇,还有挖掘空间!然后我继续检索了,“liposome and mendelian randomization and 想做的疾病”,还没有人写过,抓紧时间冲锋!那就这么决定啦~
在看文献的过程中发现了一篇的经典文章,他所用的方法我都已经掌握,且它所投的期刊的影响因子、发文量、首次回复时间都很不错,那就以这个期刊和文献为目标啦!
目标文献是:Liposomes have a direct effect on multiple myeloma: a Mendelian randomization study
目标期刊是:Front Oncol
让我们一起快速发文!冲冲冲~
Day 2-3!
挑战继续进行~
第2-3天的主要任务:精读范文+数据下载与整理+开跑代码
做任何一件事之前都需要有一个总的规划,不能一上来就盲目开始操作,这样往往做到一半还是稀里糊涂的!所以在开始跑代码之前,我又精读了10篇相关文章,了解需要做出哪些结果、用到哪些方法以后,才开始下载数据!
组学孟德尔的优点在于,它的数据量很大,当你所关注的结局和想做的组学没人研究过,且有临床或基础研究支持时,可以放心大胆的做,很可能可以出阳性结果,这是相比于数据库而言它的优势之处!对于科研小白和手上尚没有文章的医学生及医务工作者来说很友好~大家一起疯狂冲锋冲锋~
我们在课程中也推荐了一些好用的科研利器来处理数据,对于不适配的电脑,我们也准备了相关的代码,可以一键处理好外部数据。
数据整理好就可以开始跑代码啦~准备好相关数据以后,天已经很晚了,让循环代码自己跑着就准备去睡觉咯!因为数据量有点多,中途电脑又因为没电关机了,第二天晚上才跑完结果。
大家一定谨记!跑循环的时候要给电脑插上电哦~
好啦,今天的分享就到这里,一起加油呀~
Day 4!
进度汇报:处理结果+跑出图表+完成前期写作
这么快已经到第四天啦!前两天我已经把数据都跑完了,汇总表格以及结果图都也已经出来啦~接下来就是根据我们的要求进行数据筛选,然后根据筛选的结果,选出相应的留一法图、森林图、散点图、漏斗图,并整理在一起就好啦!现在数据要求越来越高了,我设的矫正P值小于0.05,这种筛选标准也比较符合目前审稿人的要求~
根据目标文献,我还需要根据我的结果做出森林图以及相关热图,拿出准备好的代码,将数据替换成自己的,就可以完美的跑出结果啦~
今天科室里不忙,结果跑完还有一定的时间富余,那就开始写作的部分吧~模仿把方法和结果部分写了,就回去休息咯~
今日份挑战成功~大家都跟上我们的节奏了吗~
Day 5!
进度汇报:完成写作+投稿前准备
昨天已经完成了写作的方法和结果部分啦!今天刚好是周末,打算一鼓作气完成剩下的部分!
根据前期的NHANES或者GBD的挑战,大家会发现我们写作的时间都不是特别长,因为写作其实是坠简单的,根据我们的“框架写作法”,任何类型的文章都可以拿下!
在写作前,我已经大量精读了类似的文章,对整个行文逻辑有了大致的了解后,才开始动的手,今天的任务量还是很重滴!需要完成引言、讨论、摘要等部分,然后翻译、润色,补充模块化语句,以及根据目标期刊的投稿要求调整内容!
意料之内~这次也在2天之内写完了初稿!将所有准备好的内容发给导师看过后,就准备投稿咯!
光速完成一篇脂质体组学孟德尔随机化,挑战成功!!!