内容如下:
1.外泌体和肝癌TCGA数据下载
2.数据格式整理
3.差异表达基因筛选
4.预后相关外泌体基因确定
5.拷贝数变异及突变图谱
6.外泌体基因功能注释
7.LASSO回归筛选外泌体预后模型
8.预后模型验证
9.预后模型鲁棒性分析
10.独立预后因素分析及与临床的相关性分析
11.列线图,ROC曲线,校准曲线,DCA曲线
12.外部数据集验证
13.外泌体模型与免疫的关系
14.外泌体模型与单细胞测序
########################### 6.外泌体基因功能注释 ############################
下面对外泌体基因功能注释的信息绘制气泡图:
代码如下:
setwd("E:\\blog外泌体相关预测模型\\Figure 1\\功能注释")
dir()
data <- read.table("BP.txt",header = T,sep = "\t