在您提供的文献《不同类型的uORF在真核生物基因表达中的调控潜力》中，对于不同类型的起始密码子的uORF及其对下游主开放阅读框（mORF）翻译效率的影响进行了详细的讨论。以下是这些影响的主要总结：

1. uORF的起始密码子类型：文献中强调了起始密码子（如AUG与非AUG）的类型对uORF翻译启动效率的显著影响。AUG密码子因其高效的识别率，通常能更有效地启动翻译，从而可能导致更强的对主开放阅读框（mORF）的抑制作用。相比之下，非AUG密码子（如CUG或GUG）由于识别效率较低，可能对mORF的抑制作用较弱。

2. 结构特征与功能机制：uORF的调控作用不仅取决于其起始密码子的类型，还受到其在mRNA中的位置、周围Kozak序列的质量、以及上游和下游元素的影响。例如，一个良好的Kozak序列可以增强AUG启动的uORF的翻译效率，而复杂的mRNA二级结构可能影响非AUG启动的uORF的识别和扫描。

3. 翻译效率的调节：文献中指出，uORF通过消耗预启动复合体或通过影响核糖体的重新加载能力来调节mORF的翻译效率。在某些情况下，特定的uORF属性或序列排列可以增强下游主编码序列的翻译，表明uORFs在调节基因表达中具有多样性和复杂性。

这些发现强调了uORFs在基因表达调控中的复杂作用，其中不同类型的起始密码子对其功能发挥了重要影响。这些机制的理解有助于深入研究uORFs在多种生物过程中的调控角色。

参考文献

2014_The_regulatory_potential_of_upstream_open_reading_frames_in_eukaryotic_gene_expression