067B-基于R语言平台Biomod2模型的物种分布建模与数据可视化-高阶课程【2025】

课程培训包含:发票+全套软件脚本学习数据+视频文件+导师答疑
本教程旨在通过系统的培训学习,学员可以掌握Biomod2模型最新版本的使用方法,最新版包含12个模型(ANN, CTA, FDA, GAM, GBM, GLM, MARS, MAXENT, MAXNET, RF, SRE, XGBOOST);通过学习掌握数据的获取处理、建模、调参和数据可视化等。课程培训针对0基础学员。
课程特点:
该套课程具有以下特点:(1)采用最新版本Biomod2-4.2.5版本,模型数量更多内容更丰富;(2)利用R一键快速统一变量数据属性(数据精度、范围、坐标系);(3)利用R一键快速对样点数据去冗余,解决ENMtool处理样点数据后数据变化问题;(4)增加适宜区变化分析制图-原始数据导出可二次制图;(5)适宜区质心快速批量计算与导出;(6)伪不存在点不同生成方式、生成数量、以及伪不存在点导出Excel数据,解决Biomod2老版本伪不存在点制图问题;(7)可以流程化自动运行出图与导出数据;

课程主要内容:
专题一 Biomod2-4.2.5和相关软件安装

  1. R软件和Biomod2-4.2.5包安装(安装报错说明)
  2. 环境变量配置与测试
  3. 辅助工具软件安装
    赠送一次软件远程协助安装测试(时间20~60min)
    专题二 基于R处理环境数据——解决数据属性不一致问题
  4. 基于R快速解决环境数据属性(范围、精度、坐标系)不一致问题
  5. 基于R利用shp地图对境数据掩膜提取与转ASC
    专题三 基于R下载样点数据与去冗余处理
  6. 利用R快速下载过滤GBIF数据(指定区域国家下载和设定数量批量下载)
  7. 利用R快速对样点去冗余(解决ENMtools处理样点数据偏移问题)–去除同一栅格内的样点数据
    专题四 变量相关性、PCA分析绘图与数据导出
  8. 基于R对变量进行相关性分析与绘制热图
  9. 相关性分析数据导出Excel
  10. PCA主成分分析与绘图
  11. 计算不同主成分的贡献率与导出数据
    专题五 Biomod2-4.2.5最新版模型和参数说明
  12. Biomod2-4.2.5主要模型介绍:ANN, CTA, FDA, GAM, GBM, GLM, MARS, MAXENT, MAXNET, RF, SRE, XGBOOST
  13. 参数设置
    专题六 伪不存在点(pseudo-absence)3种生成方式与数据导出
  14. Random法生成伪不存在点(pseudo-absence)演示与特点说明
  15. disk法生成伪不存在点(pseudo-absence)与特点说明
  16. SRE法生成伪不存在点(pseudo-absence)与特点说明
  17. 伪不存在点(pseudo-absence)数据导出到Excel
  18. 伪不存在点(pseudo-absence)生成数量设置说明和参考资料
    本章节解决了旧版biomod2生成pseudo-absence数量不准确和数据无法导出问题;并提供了合理设置Pseudo-absence数量的依据,导出的数据可以二次绘图。

专题七 多模型批量建模与模型评估绘制箱型图

  1. 建模模型参数设置修改说明(最详细参数说明版本-精确到每一行说明)
  2. 基于"KAPPA", “ROC”, “TSS”, “KAPPAsd”, “ROCsd”, "TSSsd"等指标评估模型并会图(箱型图绘制)
  3. “KAPPA”, “ROC”, “TSS”, “KAPPAsd”, “ROCsd”, "TSSsd"等指标导出到Excel(可二次绘图用)
  4. 变量重要性绘图与数据导出(箱型图绘制)
  5. 环境因子响应曲线绘制(可以指定模型、指定变量、指定PA和指定Run绘制)
  6. 环境因子响应曲线数据导出与第三方工具绘图
    本章节对结果提供了十几种格式的制图效果,可指定模型绘制,提供多种写作选择;另外所有绘图数据均导出了Excel文件,可以根据需要用专业软件进行二次绘图。
    专题八 Biomod2 EM6种集成模型使用和绘图
  7. 6种集成模型使用介绍(‘EMmean’, ‘EMcv’, ‘EMci’, ‘EMmedian’, ‘EMca’, ‘EMwmean’)
  8. 基于单一或多指标(‘TSS’, ‘ROC’,‘KAPPA’)生成集成模型
  9. 集成模型结果评价、绘图与评价指标导出
  10. 集成模型变量重要性评估与数据导出
  11. 集成模型响应曲线绘制与数据导出
    专题九 未来-过去时期批量建模预测绘图与Biomod2结果文件说明
  12. 当前时期建模结果说明与基于R快速绘图
  13. 利用R自动批量绘制适宜区图(单一模型和集成模型)
  14. 过去和未来多时期批量建模预测与绘图
    专题十 不同时期和气候情景下适宜区范围变化分析制图
  15. 过去-当前-未来(不同情景下)适宜区变化分析与制图
  16. 适宜区变化原始数据导出,可以用arcgis二次绘图(旧版biomod无此功能)
  17. 适宜区变化面积计算与导出Excel
    专题十一 不同时期适宜区质心坐标批量计算与导出
  18. 不同时期适宜区质心坐标批量计算
  19. 适宜区质心坐标导出Excel
    本章节对可以对几百个文件批量一键计算适宜区质心坐标并导出Excel,解决了SDMtools工具计算繁琐耗时的问题。
    专题十二 文章制图排版专题——补充内容
  20. 文章制图排版-AI软件使用
  21. 基于arcgis绘图教程-适宜区图
  22. 基于arcgis绘图教程-适宜区变化图
  23. 基于arcgis绘图教程-质心迁移图
    专题十三 写作思路指导 (本章节是计划内容)
  24. 学员-中文文章再现
  25. 学员-英文文章再现
    专题十三——本章节是计划内容,目前还没出,什么时间出与出的内容是否变动都不确定。
    部分学员文章:
    【1】 Modeling of Valeriana wallichii Habitat Suitability and Niche Dynamics in the Himalayan Region under Anticipated Climate Change.
    【2】 From the Balkan towards Western Europe: Range expansion of the golden jackal (Canis aureus)—A climatic niche modeling approach Effects of climate on the distribution and conservation of commonly observed European earthworms.
    【3】 Mapping multiscale breeding bird species distributions across the United States and evaluating their onservation applications.
    【4】 Corrigendum: Relocation of bioclimatic suitability of Portuguese grapevine varieties under climate change scenarios.
    【5】Gu R , Wei S , Li J ,et al.Predicting the impacts of climate change on the geographic distribution of moso bamboo in China based on Biomod2 model[J].European Journal of Forest Research, 2024, 143(5):1499-1512.DOI:10.1007/s10342-024-01706-9.
    【6】Zhang X , Wu W , Liang Y .Analysis of the Potential Distribution of Shoot Blight of Larch in China Based on the Optimized MaxEnt and Biomod2 Ensemble Models[J].Forests (19994907), 2024, 15(8).DOI:10.3390/f15081313.

部分结果展示(仅展示部分草图):

在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处:http://www.mzph.cn/pingmian/66301.shtml

如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请联系多彩编程网进行投诉反馈email:809451989@qq.com,一经查实,立即删除!

相关文章

贵州省贵安新区地图+全域数据arcgis格式shp数据矢量路网地名+卫星影像底图下载后内容测评

贵州省贵安新区地图全域数据arcgis格式shp数据矢量路网地名卫星影像底图 贵安新区地图是一款基于ArcGIS格式的地理信息系统数据集,包含2022年3月更新的详尽矢量路网、地名信息以及卫星影像底图。这款数据集是针对贵安新区这一特定区域设计的,对于规划、…

pycharm完成git项目的拉取及修改,并保存为自己的项目,以cosyvoice为例

1.新建一个项目,如图 等待几分钟。因为还要虚拟环境的建立等。 2.克隆项目源码及提前准备(备) a.git的路径。 b.githube相关设置 左角。查看。 在对话框中,填写要摘取的仓库,提示非空目录。我给加了一个main 完成后&a…

Appium(一)--- 环境搭建

一、Android自动化环境搭建 1、JDK 必须1.8及以上(1) 安装:默认安装(2) 环境变量配置新建JAVA_HOME:安装路径新建CLASSPath%JAVA_HOME%\lib\dt.jar;%JAVA_HOME%\lib\tools.jar在path中增加:%JAVA_HOME%\bin;%JAVA_HOME%\jre\bin;(3) 验证…

Ant Design中Flex布局、Grid布局和Layout布局详解

好的,我们来更详细地探讨 Ant Design 中的 Flex布局、Grid布局 和 Layout布局 的特点、用法、适用场景,以及如何灵活运用它们来构建页面。下面将从各个方面进行更深入的分析,并提供具体的实例。 VueFlex布局实现响应式布局 1. Flex布局 概念…

Redis两种主要的持久化方式是什么?

Redis支持两种主要的持久化方式,它们分别是RDB(Redis Database Snapshotting)和AOF(Append Only File)。以下是这两种持久化方式的详细介绍: 一、RDB(Redis Database Snapshotting) …

flink cdc oceanbase(binlog模式)

接上文:一文说清flink从编码到部署上线 环境:①操作系统:阿里龙蜥 7.9(平替CentOS7.9);②CPU:x86;③用户:root。 预研初衷:现在很多项目有国产化的要求&#…

C++文件流 例题

问题: 设计一个留言类,实现以下的功能: 1) 程序第一次运行时,建立一个 message.txt 文本文件,并把用户输入的信息存入该文件; 2) 以后每次运行时,都先读取该文件的内容并显示给用户&#xff…

遮挡半透明效果

1、遮挡半透明效果是什么 在游戏开发中,遮挡半透明效果就是物体被挡住的部分,也能呈现出一种半透明效果而被看到(具体效果可以自定义)比如 当角色在建筑物之间穿行时,被遮挡部分能够呈现出半透明效果而被我们看到。遮…

大模型高效推理综述

大模型高效推理综述 1 Introduction2 Preliminaries2.1 transformer架构的LLM2.2 大模型推理过程2.3 推理效率分析 3 TAXONOMY(分类)4.数据级别优化4.1输入压缩4.1.1 提示词裁剪(prompt pruning)4.1.2 提示词总结(prompt summary)…

计算机网络--UDP和TCP课后习题

【5-05】 试举例说明有些应用程序愿意采用不可靠的UDP, 而不愿意采用可靠的TCP。 解答: 这可能有以下几种情况。 首先,在互联网上传输实时数据的分组时,有可能会出现差错甚至丢失。如果利用 TCP 协议对这些出错或丢失的分组进行重传&…

Go语言的基础知识

1, Go 语言介绍 Go 即 Golang,是 Google公司2009年11月正式对外公开的一门编程语言。 根据 Go 语言开发者自述,近10多年,从单机时代的C语言到现在互联网时代的Java,都没有令人满意的开发语言,而C往往给人的感觉是,花了100%的经历…

【UE5 C++课程系列笔记】20——共享指针的简单使用

目录 概念 创建共享指针示例 重设共享指针 共享指针内容转移 共享指针和共享引用的转换 判断共享指针的相等性 共享指针访问成员函数 自定义删除器 概念 共享指针(主要以 TSharedPtr 为例),TSharedPtr 基于引用计数机制来工作&#x…

flux中的缓存

1. cache,onBackpressureBuffer。都是缓存。cache可以将hot流的数据缓存起来。onBackpressureBuffer也是缓存,但是当下游消费者的处理速度比上游生产者慢时,上游生产的数据会被暂时存储在缓冲区中,防止丢失。 2. Flux.range 默认…

Ubuntu网络连接问题(笔记本更换wifi后,虚拟机连不上网络)

1、笔记本更换wifi后,虚拟机的IP地址变了,然后就连不上网络了(主机笔记本连接wifi正常上网) 2、修改子网地址(按照ubutun的ip设置子网掩码) 3、Ubuntu已经显示网络连接正常了,但是就是无法上网&…

如何在 Ubuntu 22.04 上安装 Cassandra NoSQL 数据库教程

简介 本教程将向你介绍如何在 Ubuntu 22.04 上安装 Cassandra NoSQL 数据库。 Apache Cassandra 是一个分布式的 NoSQL 数据库,旨在处理跨多个普通服务器的大量数据,并提供高可用性,没有单点故障。Apache Cassandra 是一个高度可扩展的分布…

Spring MVC实战指南:构建高效Web应用的架构与技巧(三)

响应数据和结果视图(7种) 返回值分类 创建web.xml&#xff08;spring、过滤器解决乱码、配置控制器dispatcherServlet、加载springmvc.xml文件、配置启动加载&#xff09;创建springmvc.xml文件 <!--配置了内容&#xff0c;启动Tomcat服务器的时候&#xff0c;就会被加载--…

oscp备考 oscp系列——Kioptix Level 1靶场 古老的 Apache Vuln

目录 前言 1. 主机发现 2. 端口扫描 3. 指纹识别 4. 目录扫描 5. 漏洞搜索和利用 前言 oscp备考&#xff0c;oscp系列——Kioptix Level 1靶场 Kioptix Level 1难度为简单靶场&#xff0c;主要考察 nmap的使用已经是否会看输出&#xff0c;以及是否会通过应用查找对应漏…

Linux下编译安装PETSc

本文记录在Linux下编译安装PETSc的流程。 零、环境 操作系统Ubuntu 22.04.4 LTSVS Code1.92.1Git2.34.1GCC11.4.0CMake3.22.1oneAPI2024.2.1 一、安装依赖 1.1 安装oneAPI 参见&#xff1a;Get the Intel oneAPI Base Toolkit , Get the Intel oneAPI HPC Toolkit 1.2 安…

深入Android架构(从线程到AIDL)_11 线程之间的通信架构

目录 5、 线程之间的通信架构 认识Looper与Handler对象 主线程丢信息给自己 子线程丢信息给主线程 替子线程诞生Looper与MQ 5、 线程之间的通信架构 认识Looper与Handler对象 当主线程诞生时&#xff0c;就会去执行一个代码循环(Looper)&#xff0c;以便持续监视它的信息…

【中间件】docker+kafka单节点部署---zookeeper模式

提示&#xff1a;文章写完后&#xff0c;目录可以自动生成&#xff0c;如何生成可参考右边的帮助文档 文章目录 前言消息中间件介绍1. KRaft模式2. zookeeper模式2.1. 单节点部署安装验证 前言 最近生产环境上准备部署ELFK日志监控&#xff0c;先在测试环境部署单节点kafka验证…