介绍
热图展示参与者的属性,散点图表示样本的时间跨度。
加载R包
library(tidyverse)
library(ComplexHeatmap)
library(circlize)
library(cowplot)
导入数据
数据可从以下链接下载(画图所需要的所有数据):
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百度云盘链接: https://pan.baidu.com/s/1iEE9seTLdrrC3WDHJytvIQ
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提取码: yvf5
load("figure1ab.RData")
数据预处理
tumortype_order <- tmn_meta_data$dx1_tumortype %>% table %>% sort %>% names
patient_order <- with(tmn_meta_data, setNames(dx1_tumortype, upn)) %>% .[order(match(., tumortype_order))] %>% namestmn_meta_data_processed <- tmn_meta_data %>%mutate(upn = factor(upn, l