代谢组数据分析(十四):代谢物组间网络分析(spearman coefficient)

在这里插入图片描述

介绍

在代谢物网络分析领域,研究者采用斯皮尔曼系数来定量评估代谢物之间的相关性。该系数作为一种有效的非参数统计工具,能够揭示代谢物间潜在的关联模式,不受它们分布特性的限制。通过计算所有代谢物配对间的斯皮尔曼系数,研究者能够构建出反映代谢物相互关系的网络。

进一步地,基于特定的分组标准,例如不同的生物学状态或样本类别,研究者能够分别构建各个分组的代谢物网络。通过细致地比较这些网络,可以观察到代谢物相互作用模式在不同分组间的变化,进而识别特定条件下代谢途径的调控差异或代谢物的异常表达行为。

此外,对两个代谢网络进行差异性分析,有助于深入理解不同生物学条件下代谢过程的动态变化,为揭示代谢调控机制提供重要线索。这种分析方法不仅增强了我们对代谢网络结构和功能的理解,也为代谢相关疾病的诊断和治疗提供了新的视角。

加载R包

导入所需要的R包,在导入前需要用户自己安装。

library(tidyverse)
library(SummarizedExperiment)
library(patchwork)# rm(list = ls())
options(stringsAsFactors = F)
options(future.globals.maxSize = 1000 * 1024^2)grp_names <- c("None", "Mild", "Moderate", "Severe")
grp_colors <- c("

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处:http://www.mzph.cn/pingmian/46582.shtml

如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请联系多彩编程网进行投诉反馈email:809451989@qq.com,一经查实,立即删除!

相关文章

03. Java 条件查询

1. 前言 在 MySQL 中使用 select 查询语句的时候&#xff0c;一般都会加上 where 语句或者 limit 语句限定查询结果的范围&#xff0c;两种子句都是过滤的作用。另外还有和 group by 语句配合使用的 having 限制条件。区分 where 和 having 语句的作用也是比较基础的题目。 2.…

OpenCV教程:cv2图像逻辑运算

-------------OpenCV教程集合------------- Python教程99&#xff1a;一起来初识OpenCV&#xff08;一个跨平台的计算机视觉库&#xff09; OpenCV教程01&#xff1a;图像的操作&#xff08;读取显示保存属性获取和修改像素值&#xff09; OpenCV教程02&#xff1a;图像处理…

Git钩子Hook功能

&#x1f4be; Hook 钩子 目录 &#x1f514; 简介&#x1f514; 常见类型&#x1f514; 如何配置&#x1f514; 使用场景&#x1f514; 示例 &#x1f514; 简介 Git Hooks是Git内置的一种机制&#xff0c;允许在特定事件发生时执行自定义脚本。Git Hook可以在客户端和服务器端…

PHP多功能投票微信小程序系统源码

&#x1f389;一键决策&#xff0c;尽在掌握&#xff01;多功能投票小程序&#xff0c;让选择不再纠结&#x1f914; &#x1f4f2;【开篇&#xff1a;告别传统&#xff0c;拥抱便捷投票新时代】&#x1f4f2; 还在为组织投票活动手忙脚乱&#xff1f;或是面对众多选项犹豫不…

Hadoop发展史和生态圈介绍

目录 一、Hdoop概述 二、Hadoop生态组件 三、大数据的技术生态体系 四、Hadoop发展历史 4.1 概述 4.2 Hadoop历史发展节点 4.2.1 2002-2004年理论阶段 4.2.2 2005-2008年Hadoop的问世与崛起 4.2.3 2009-2017年Hadoop助力大数据行业的发展 4.2.4 至今 五、Hadoop优势特…

华为HCIP Datacom H12-821 卷40

1.单选题 下面是台路由器BGP错误输出信息&#xff0c;关于这段信息描述错误的是 <HUAWEI>display bgp error Error Type :Peer Error Date/Time :2010-03-22 12:40:39 Peer Address :10.1.1.5 Error Info : Incorrect remote AS A、可能是由于邻居…

面向 AI 而生的香橙派 AIpro 开发板开箱实测

前几天搞到一块很牛掰的开发板&#xff0c;是香橙派联合华为精心打造的高性能 AI 开发板 – OrangePi AIpro 开发板。 其搭载了昇腾 AI 处理器&#xff0c;可提供 8TOPS INT8 的计算能力&#xff0c;作为单板硬件设备来说&#xff0c;算力杠杠的了&#xff0c;至于跑 AI 模型性…

django实现用户的注册、登录、注销功能

创建django项目的步骤&#xff1a;Django项目的创建步骤-CSDN博客 一、前置工作 配置数据库&#xff0c;设置数据库引擎为mysql 1、在settings文件中找到DATABASES, 配置以下内容 DATABASES {"default": {ENGINE: django.db.backends.mysql, # 数据库引擎NAME: dja…

params和data的差别,doc下载

params和data的差别 export function downFile(url, parameter, method) {return axios({url: url,params: parameter,method: method ? method : "get",responseType: "blob",}); }// params: parameter,请求的参数&#xff0c;会作为查询字符串附加到…

实习随笔【前端技术实现全局添加水印】

有一些数据比较重要的项目&#xff0c;往往需要对数据进行保护措施&#xff0c;本文介绍常见策略——全局添加水印。 1、创建水印组件 <template><div class"water-mark"><div class"water-mark-content"><span class"phone&qu…

打破平台限制,使智能手机和平板电脑上无缝运行Windows x86/x64架构的软件和游戏的一款安卓应用

大家好&#xff0c;今天给大家分享一款专为Android设备设计的模拟器应用Winlator。其核心功能是能够在基于ARM架构的智能手机和平板电脑上无缝运行Windows x86/x64架构的软件和游戏。 Winlator是一款Android应用程序&#xff0c;它允许用户使用Wine和Box86/Box64在Android设备上…

docker-compose部署redis-exporter

一、安装prometheus 1、安装 version: 3.1services:redis-exporter:image: bitnami/redis-exporter:latestcontainer_name: redis-exporterports:- 9121:9121environment:TZ: Asia/Shanghaicommand:- --redis.addrredis://127.0.0.1:6379# - --redis.passwordlabels:org.labe…

C#学习3-微软C#官方文档Microsoft-dotnet-csharp.pdf

文章目录 1.内插表达式的字段宽度和对齐方式 1.内插表达式的字段宽度和对齐方式 static void Main(string[] args) {var titles new Dictionary<string, string>() {["Doyle ,Arthur"] "Hound of the Basker,The",["Lodon ,Jack"] &quo…

PHP恋爱话术微信小程序系统源码

&#x1f496;恋爱高手的秘密武器&#xff01;恋爱话术微信小程序&#xff0c;让情话信手拈来✨ &#x1f4ad;【开场白&#xff1a;恋爱路上的甜蜜助手】&#x1f4ad; 还在为跟心仪的TA聊天时找不到话题而尴尬&#xff1f;或是担心自己说的每句话都显得那么“直男/女”&…

Linux上启动和停止jar

linux 后台运行jar 在Linux系统中&#xff0c;要想让jar包在后台运行&#xff0c;可以使用nohup命令和&符号。nohup命令可以使进程在后台不受挂起信号影响的执行&#xff0c;而&符号则是将任务放入后台执行。 以下是一个简单的命令示例&#xff0c;它将启动一个jar包…

记一次使用vue连接rabbitMq

连接rabbitMq需要使用stompjsnpm i stompjs 下下面是连接代码 import Stomp from stompjsonConnected(frame) {// 绑定交换机exchange_pushmsg是交换机的名字rk_pushmsg是绑定的路由keyvar exchange this.rabbitMqexchange || queue.device.zzzz// 创建随机队列用上面的路由k…

安全编织:Eureka驱动的分布式服务网格安全策略

安全编织&#xff1a;Eureka驱动的分布式服务网格安全策略 在微服务架构的复杂网络中&#xff0c;服务的安全性是维护系统稳定运行的基石。服务网格&#xff08;Service Mesh&#xff09;作为微服务间通信的代理层&#xff0c;承担着保障服务间通信安全的重要职责。Eureka&…

vi 编辑器快捷生成 main 函数和基本框架

step1: 执行 sudo vi /etc/vim/vimrc &#xff08;修改vimrc需要管理员权限&#xff1a;sudo&#xff09; step2:输入用户密码&#xff0c;回车, 编辑vimrc文件 step3:在尾行输入以下代码&#xff08;可复制&#xff09; map mf i#include<stdio.h><ESC>o#includ…

Web3发展的基本要素

区块链&#xff1a;分布式数据库 1 区块链是一种新型的分布式数据库协议&#xff0c;是实现Web3的最核心技术。 2 区块链的技术特性使其能够&#xff1a; 1&#xff09;安全地存储数据&#xff0c;得益于现代计算机密码学&#xff0c;用户可以获得自己独特、安全的账户&…

java itextPdf根据pdf模板,编辑保存pdf后可二次编辑处理

java 支持pdf 多次编辑的重点只有两个 1&#xff1a;flat属性 2&#xff1a;设置文本域只读属性 看似简单的两个问题&#xff0c;却耗费了一天的时间。pdf没有官方文档太难受了&#xff0c;只能在网上查找相关的案 例。但是很多文章都是copy别人的。没有实际效果。皇天不负有…