BioTech - 输入 自定义复合物(Multimer)模版 使用 AlphaFold2 进行精细预测

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Template

参考:研发 AlphaFold2 输入自定义模版 (Template) 的接口

在 AlphaFold 预测蛋白质三维结构中,结构 模版(Template) 起着关键作用:

  • 蛋白质结构模板:已知的蛋白质结构的集合,这些已知结构通常来自实验数据或者预测结构,使用这些已知结构作为模板,以帮助预测未知蛋白质的三维结构。
  • 模板比对:首先,将目标蛋白质的氨基酸序列与已知结构模板进行比对。通过比对,可以找到与目标蛋白质相似的模板,从而为预测提供参考。
  • 模板信息的利用:使用模板信息来约束预测模型。具体来说,将目标蛋白质的序列与模板对齐,以确定哪些部分与已知结构相似。模板信息有助于更准确地预测目标蛋白质的结构,特别是在缺乏实验数据的情况下。
  • 模板的重要性:模板提供了一种类似的蛋白

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