哥伦比亚大学Harris H. Wang团队 在《Nature Microbiology》期刊上(IF=28.3)发表了关于409种细菌-药物对揭示肠道微生物群扰动的驱动因素的文章，该研究通过对转录组学测定结果进行生信分析，强调了大规模转录组学在肠道微生物-外源化学物相互作用的功能发现方面的实用性。

• 期刊：Nature Microbiology

• 影响因子：28.3         

• 发表时间：2024.02

• 样本类型：细菌、人粪便

一、研究背景

许多药物可以扰乱肠道微生物群，有可能导致负面的健康后果。然而，大多数微生物-药物反应的机制尚未在遗传水平上阐明。本研究利用高通量转录组学，系统地描述了暴露于最常用的口服药物的流行的人类肠道细菌的基因表达谱，为了解药物介导的微生物群转移的驱动因素提供了一个资源，以便更好地了解临床干预。

二、研究思路

图 研究思路 注：BMIS：自身体质量指数谱

三、研究结论

本研究通过高通量原核转录组学方法，系统分析了常用口服药物对常见人类肠菌基因表达的影响，涉及409个药物-肠菌配对，为理解药物介导的菌群改变提供了机制性见解和研究资源；他汀类药物能上调拟杆菌目细菌的AcrAB-TolC外排泵，使这些菌对膳食成分（如维生素A）和次级胆汁酸的抗菌/毒性作用更敏感，服用辛伐他汀的患者中携带acrAB-tolC基因的肠菌减少，侧面印证他汀类药物引起的肠菌acrAB-tolC表达上调会影响细菌活性。

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参考文献

Ricaurte D, et al. High-throughput transcriptomics of 409 bacteria-drug pairs reveals drivers of gut microbiota perturbation. Nat Microbiol. 2024.