【Lammps】atomsk安装与环境变量设置(Linux环境)
- 官网
- 配置环境变量
- 测试
官网
https://atomsk.univ-lille.fr/dl.php
下载的安装包如下:
使用Linux的解压命令进行解压:
tar -xzvf file.tar.gz
注意:file.tar.gz 替换为自己下载的安装包名称。
解压后有如下文件:
我们看到有examples文件夹,里面有很多atomsk自带的例子,我们直接进去运行看看,能不能成功?
用 bash XX.sh 或source XX.sh
以Al_dislocation.sh为例运行,
首次运行报错,显示报错:
-bash: atomsk: command not found
这是由于环境变量没有设置,所有atomsk命令没有生效,接下来添加atomsk到当前用户的环境变量。
配置环境变量
- 找到当前的 atomask 所在文件的路径
先cd到我们最开始安装的位置,然后使用pwd
命令即可。
比如我的atomsk的路径为:
/data/home/hw23/atomsk_b0.13.1_Linux-amd64
- 找到atomsk的路径后,前往用户的根目录(可以使用命令
cd /
)
3. 编辑 bashrc
输入 vi .bashrc
,然后回车,出现如下内容,在箭头下面加入如下内容:
export PATH=“$PATH:/home/zma/software/atomsk_b0.11.2_Linux-amd64”
export PATH="$PATH:/data/home/hw23/atomsk_b0.13.1_Linux-amd64"
这个路径根据 atomsk文件 所在安装路径而定。
- 输入source .bashrc,然后回车。使刚才的环境变量生效。直接输入atomsk也可以进入atomsk软件了。
可以用echo $PATH命令查看,atomsk所在路径已经添加进来了。
测试
测试:回到刚才Al_supercell.sh所在路径,再执行source Al_supercell.sh命令
运行成功!结果如下图:
参考博客:
https://www.bilibili.com/read/cv16793408/