【LAMMPS学习】二、LAMMPS安装(3)通过Conda/tarball/git安装LAMMPS

2. LAMMPS安装

您可以将LAMMPS下载为可执行文件或源代码。
在下载LAMMPS源代码时，还必须构建LAMMPS。但是对于在构建中包含或排除哪些特性，您有更大的灵活性。当您下载并安装预编译的LAMMPS可执行文件时，您只能安装可用的LAMMPS版本以及这些构建中包含的特性。如果您计划修改或扩展LAMMPS，那么您必须从源代码构建LAMMPS。

[请注意]如果您对预编译的LAMMPS可执行文件有疑问，您需要联系准备这些可执行文件的人员。LAMMPS开发人员无法控制他们如何配置和构建他们的包以及何时更新它们。

2.1.下载适用于 Linux 的可执行文件

2.2.下载 macOS 的可执行文件

2.3.下载适用于 Windows 的可执行文件

2.4.通过 Conda 下载适用于 Linux 或 macOS 的可执行文件

预编译的 LAMMPS 二进制文件可通过 Conda 包管理系统用于 macOS 和 Linux。

首先，必须在系统上设置 Conda 包管理器。按照说明安装 Miniconda，然后为您的 LAMMPS 安装创建一个 conda 环境（命名为 my-lammps-env 或您喜欢的任何名称）：

conda config --add channels conda-forge
conda create -n my-lammps-env

LAMMPS 二进制文件是使用 KIM 包构建的，这导致 Conda 在安装 LAMMPS 时也会安装 kim-api 二进制文件。为了使用 openkim.org 的潜力，您可以安装 openkim-models 包

conda install openkim-models

2.5.通过 tarball 形式下载源代码和文档

您可以从 LAMMPS 网站的下载页面或 GitHub（见下文）下载最新的 LAMMPS tarball。

您有两种 tarball 选择：最新的稳定版本或最新的功能版本。稳定版本每年发布几次，并在发布前经过更多测试。此外，在稳定版本之间，功能版本中的错误修复会向后移植，并且 tarball 偶尔也会更新。功能每 4 到 8 周发布一次。所有功能版本中的新内容都列在 LAMMPS 主页的 bug 和功能页面上。

旧版 LAMMPS 版本的 tarball 也可以从此页面下载。

从 LAMMPS 主页下载的 tarball 包括与该版本对应的预编译的 LAMMPS 文档（HTML 和 PDF 文件）。

获得 tarball 后，使用以下命令解压缩它：

tar -xzvf lammps*.tar.gz

这将创建一个 LAMMPS 目录，其名称中包含版本日期，例如lammps-28Mar23。

您还可以从 LAMMPS GitHub 发布站点的“资产”部分下载压缩的 tar 或 zip 存档。文件名为 lammps-<version>.zip，可以使用以下命令解压缩，以创建 lammps-<version> 目录：

unzip lammps*.zip

此版本对应于所选的 LAMMPS 功能或稳定版本（如匹配的 git 标签所示），并且仅包含源代码，没有预构建的文档。

2.6.通过 git 下载 LAMMPS 源代码

LAMMPS 开发是通过“LAMMPS GitHub 站点”协调的。如果将 LAMMPS 存储库克隆到本地计算机上，它具有以下几个优点：

您可以通过一个git命令了解LAMMPS的最新变化。
您可以创建自己的开发分支来向LAMMPS添加代码。
您可以将您的新功能提交回GitHub以包含在LAMMPS中。为此，您应该首先在GitHub上创建自己的分支。

您必须在系统上安装 git 才能使用下面解释的命令与 GitHub 上的 git 服务器进行通信。对于仍在使用 subversion (svn) 的人们，GitHub 还为 subversion 客户端提供有限的支持。

您可以在 4 个不同的 git 分支上关注 LAMMPS 开发：

开发版:这个分支遵循正在进行的开发，并随着拉取请求发布的每个合并提交而更新
发行版;更新总是从开发中快速合并而来
维护版:这个分支收集从开发分支到稳定分支的后移植错误修复。它用于为稳定更新版本更新稳定分支。
稳定版:这个分支在每个稳定版本中都会从发布分支更新，并且当维护分支合并到它中时，也会在每个更新版本中选择错误修复

要访问您机器上的 git 存储库，请使用克隆命令创建 LAMMPS 存储库的本地副本，命令如下：

git clone -b release https://github.com/lammps/lammps.git mylammps

其中“mylammps”是您希望在计算机上创建的目录的名称，“release”是上面列出的 3 个分支之一。（请注意，您实际上下载了所有 3 个分支；您可以随时使用“git checkout <branch name>”在它们之间切换。）

命令完成后，您的目录将包含与解压当前 LAMMPS tarball 相同的文件，但不包括 HTML 文档文件。通过在 doc 目录中键入 make html ，可以根据 doc/src 中提供的内容生成它们。

初始克隆后，随着 LAMMPS 中添加错误修复和新功能，您可以通过在“mylammps”目录中键入以下 git 命令来保持最新状态：

git checkout release      # not needed if you always stay in this branch
git checkout stable       # use one of these 4 checkout commands
git checkout develop      # to choose the branch to follow
git checkout maintenance
git pull

执行“拉取”不会更改您添加到 LAMMPS 目录结构中的任何文件。它也不会更改您编辑的任何现有 LAMMPS 文件，除非这些文件在存储库中已更改。在这种情况下，git 将尝试将存储库文件中的更改与您的文件版本合并，并告诉您是否存在任何冲突。有关详细信息，请参阅 git 文档。

如果您想访问 LAMMPS 的特定先前发布版本，您可以“签出”带有已发布标签的任何版本。有关标签列表，请参阅 git tag -l 的输出。执行此操作的 git 命令如下。