多轨迹建模方法的介绍与实操-基于R语言

本文介绍了多轨迹建模方法(Group-Based Multivariate Trajectory Modeling),这是一种扩展了单指标组基轨迹建模的技术,用于分析多个疾病生物标志物或临床重要因素的联合轨迹,以更好地理解和追踪疾病进程、行为或健康状态的变化。多轨迹建模利用有限混合模型,识别出遵循相似多指标轨迹的个体群体。这种方法克服了传统统计分析在处理多变量纵向数据时的局限性,允许同时分析多个相关指标。通过两个示例展示了该模型的实施过程和应用。

1. 引言

- 现有统计方法通常未能充分利用多变量纵向数据中的信息来研究疾病进展的多个指标。

- 多轨迹建模旨在通过同时分析多个指标的轨迹,提高对疾病发展等的理解。

2. 多轨迹建模方法

- 基于有限混合模型,多轨迹建模扩展了单指标的组基轨迹建模。

- 每个轨迹群由多个指标的轨迹定义,而不是仅一个指标。

3. 确定组数

- 选择合适的组数是关键,需要结合统计标准和实质性的解释。

- 不能仅依赖于机械的拟合统计量,模型选择应考虑其实质性意义。

【确定多轨迹模型中的最佳组数通常涉及统计标准,但同时也需要考虑其他因素。这些因素可能包括临床相关性、模型的解释能力和复杂性之间的平衡。选择最佳组数时,需要确保模型能够清晰、简洁地代表临床相关的轨迹模式,同时避免过度拟合数据,即创建过多的组以至于每个组包含的数据量过少或模式过于特定。此外,模型的实用性也是一个重要因素,理想的模型应该易于理解和应用到实际的临床决策中。】

4.  实现方法

4.1 准备阶段

install.packages("gbmt")
library(gbmt)
data(agrisus2)

4.2 分析阶段

1. 进行gbmt分析,以每个国家为一个个体,ng=创建的组数,d=表示组轨迹的多项式次数。默认值为 2,scaling=归一化方法,应表示为:0(无归一化)、1(居中)、2(标准化)、3(与平均值的比率)和4(与平均值的对数比率)。默认值为 2(标准化)

varNames <- c("TFP_2005", "NetCapital_GVA", "Income_rur", "Unempl_rur", "GHG_UAA", "GNB_N_UAA") # 定义6 个自变量
m3_2 <- gbmt(x.names=varNames, unit="Country", time="Year", d=2, ng=3, data=agrisus2, scaling=4)   # 分为3组
m3_2$assign.list
m3_2$fitted
summary(m3_2)
m4_2 <- gbmt(x.names=varNames, unit="Country", time="Year", d=2, ng=4, data=agrisus2, scaling=4) # 分为4组rbind(m3_2$ic, m4_2$ic)

选择多少组别数量?

通常在使用`gbmt`这样的方法时,研究人员可能会基于理论背景、数据的聚类结构或者通过比较不同组数(ng)的模型来决定。例如,他们可能从一个较小的组别数量开始(如3个组),然后逐渐增加组别,直到模型的复杂性与数据的解释能力达到平衡,或者模型的信息准则(如IC值)不再有显著改善。

在示例代码中,模型`m3_2`使用了3个组,而`m4_2`尝试了4个组,这表明可以通过比较不同组数模型的拟合情况来选择合适的组别数量。

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处:http://www.mzph.cn/news/732215.shtml

如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请联系多彩编程网进行投诉反馈email:809451989@qq.com,一经查实,立即删除!

相关文章

2024蓝桥杯每日一题(归并排序)

一、第一题&#xff1a;火柴排队 解题思路&#xff1a;归并排序 重点在于想清楚是对哪个数组进行归并排序求逆序对 【Python程序代码】 from math import * n int(input()) a list(map(int,input().split())) b list(map(int,input().split())) na,nb [],[] for …

c++结构体中定义函数方法介绍

在C中&#xff0c;结构体&#xff08;Struct&#xff09;是一种用户自定义的数据类型&#xff0c;用于组织不同数据类型的成员。结构体可以包含变量、常量、函数等&#xff0c;使得数据的组织更加灵活。以下是关于C结构体中函数的介绍&#xff1a; 结构体声明&#xff1a; 在介…

【OpenGL手册12】 统一变量Uniform

OpenGL基础 - 统一变量Uniform 目录 一、说明二、 Uniform变量概念2.1 Uniform变量和特点2.2 Uniform变量定义方法2.3 Uniform变量赋值和传参 三、如何在Shader中自定义Location四、赋值五、统一变量缓冲对象六、赋值函数 一、说明 关于统一变量&#xff0c;也有一系列概念和方…

【嵌入式】字体极限瘦身术:Fontmin在嵌入式UI中的魔法应用(附3500常用汉字)

1. 概述 在嵌入式系统的用户界面&#xff08;UI&#xff09;设计中&#xff0c;字体的选择和优化至关重要。一个恰当的字体不仅能够提升用户体验&#xff0c;还能彰显产品特色。然而&#xff0c;由于嵌入式设备常常受限于存储空间和处理能力&#xff0c;大型字体文件可能成为性…

代码随想录算法训练营第五十五天丨583. 两个字符串的删除操作、72. 编辑距离

583. 两个字符串的删除操作 开窍了 class Solution:def minDistance(self, word1: str, word2: str) -> int:n1, n2 len(word1), len(word2)dp [[0] * (n2 1) for _ in range(n1 1)]for i in range(1, n1 1):dp[i][0] ifor j in range(1, n2 1):dp[0][j] jfor i i…

LeetCode的使用方法

LeetCode的使用方法 一、LeetCode是什么&#xff1f;1.LeetCode简介2.LeetCode官网 二、LeetCode的使用方法1.注册账号2.力扣社区力扣编辑器 2.1 讨论发起讨论参与讨论关注讨论 2.2 文章撰写文章关注文章 3.力扣面试官版测评面试招聘竞赛 4.力扣学习LeetBook 书架我的阅读猜您喜…

支付宝开放平台证书验签生成签名接入方式的操作流程之公钥证书,密钥证书的生成

#小李子9479# 调用支付宝接口的安全验证方式均使用sign_type为RSA2的方式&#xff0c;有两种 1。密钥模式&#xff1a;应用公钥、应用私钥、平台公钥生成签名和验签方式 2。证书模式&#xff1a;支付宝根证书、支付宝公钥证书、应用公钥证书、应用私钥&#xff0c;采用RSA20…

【2024.3.8练习】[2015 国 AC] 穿越雷区

题目描述 题目分析 最短步数问题&#xff0c;采用BFS算法即可。 我的代码 #include <iostream> #include <algorithm> #include <queue> #include <cmath> using namespace std; int n; int ans; int flag; const int max_n 102; char map[max_n][m…

Qt初识 - 编写Hello World的两种方式 | 对象树

目录 一、通过图形化方式&#xff0c;在界面上创建出一个控件 二、通过代码方式&#xff0c;创建Hello World 三、Qt 内存泄漏问题 (一) 对象树 一、通过图形化方式&#xff0c;在界面上创建出一个控件 创建项目后&#xff0c;打开双击forms文件夹中的ui文件&#xff0c;可…

【java基础】异常处理机制

目录 1、异常体系介绍 1.1、异常是什么? 1.2、运行时异常和编译时异常的区别? 2、异常的用法 2.1、捕获异常 2.2、异常中的常见方法 2.3、抛出异常 2.4、自定义异常 1、异常体系介绍 1.1、异常是什么? java异常是指在程序运行时可能出现的一些错误&#xff0c;如&am…

把flask 项目部署在windows上步骤

1.激活虚拟环境 # 激活到系统Python环境&#xff08;如果当前已经在venv中&#xff0c;需要先退出&#xff09; C:\xxx>deactivate # 删除现有的虚拟环境文件夹 C:\xxx>rmdir /s /q venv # 创建新的虚拟环境 C:\xxx>python -m venv venv # 激活新的虚拟环…

责任链模式(Chain of Responsibility Pattern)

责任链模式 说明 责任链模式&#xff08;Chain of Responsibility Pattern&#xff09;属于行为型模式&#xff0c;它是指使多个对象都有机会处理请求&#xff0c;将这些对象连成一条链&#xff0c;并沿着这条链传递该请求&#xff0c;直到有一个对象处理它为止。从而避免请求…

IntelliJ IDEA自定义关闭当前文件的快捷方式

前言 idea中关闭当前标签页的默认快捷键是CtrlF4,这个组合键在键盘上操作起来很是不方便&#xff0c;我们可以在设置中自定义自己习惯的快捷方式。 自定义步骤 要在 IntelliJ IDEA 中将关闭当前文件的快捷方式设置为 Alt Q&#xff0c;请按照以下步骤操作&#xff1a;打开 …

Vue+Element页面生成快照截图

页面部分: <template><div ref"homePage" class"home-container rel"><div class"snap-box abs"><div title"页面快照" class"z-pointer" click"newSnapShot()"><img :src"snap…

ES分布式搜索-索引库操作

索引库操作 1、mapping映射属性 可以查看官方文档学习&#xff1a;ES官方手册 mapping是对索引库中文档的约束&#xff0c;常见的mapping属性包括&#xff1a; type&#xff1a;字段数据类型&#xff0c;常见的简单类型有&#xff1a; 字符串&#xff1a;text&#xff08;可…

github Commits must have verified signatures

1.首先确认是否有权限&#xff0c;如有权限的情况下那就是配置有问题了 我的情况是&#xff0c;能拉取代码&#xff0c;提交的时候出现这种情况&#xff1a;Commits must have verified signatures 这里是生成证书&#xff0c;如果已经生成过的&#xff0c;就不用生成了 ssh…

ARM/Linux嵌入式面经(一):海康威视

海康威视 1.函数指针和指针函数区别 1.定义的差异 函数指针&#xff1a;函数指针的定义涉及到函数的地址。例如&#xff0c;定义一个指向函数的指针 int (*fp)(int)&#xff0c;这里 fp 是一个指针&#xff0c;它指向一个接受一个整数参数并返回整数的函数。 指针函数&#…

99 centos 7 服务器上面 增加了 2181 的防火墙配置, 但是客户端连接不上

呵呵 最近部署 zookeeper 的时候出现这样的一个问题 centos 7 服务器上面 增加了 2181 的防火墙配置, 但是客户端连接不上 # 但是再 另外的一个虚拟机环境, ubuntu 16 的环境, docker 启动 2181 的服务, 然后 安装 firewalld, 配置 开放 2181 的 tcp 服务, 客户端能够正常连接…

《C缺陷和陷阱》-笔记(2)

提示&#xff1a;文章写完后&#xff0c;目录可以自动生成&#xff0c;如何生成可参考右边的帮助文档 目录 文章目录 前言 一、理解函数声明 1.(*(void(*)( ))0)( ); 2.signal 函数接受两个参数&#xff1a; 3.使用typedef 简化函数声明&#xff1a; 二、运算符的优先级…

代码随想录刷题第54天

倒计时day6。第一题是判断子序列https://leetcode.cn/problems/is-subsequence/description/&#xff0c;动规五步曲分析如下&#xff1a;dp[i][j]表示以下标为i - 1的字符串1与下标为j - 1的字符串2的相同子序列长度。当发现str1[i - 1] str2[j - 1]时&#xff0c;相同子序列…