MIMIC-IV官方视图解析 - cardiac

MIMIC-IV官方视图解析 - cardiac_marker心脏标记表

今天在学习官方衍生表mimiciv_derived.cardiac_marker心脏标记表时候发现了一些问题：

该表中troponin_t （肌钙蛋白t）的值结果都是空值null 或者 ___ （由于去标识化），这明显是不合理的

小编查看了该表的官方生成sql。

几乎每个值都是 ___ （由于去标识化），因此派生表具有所有空值。然而 valuenum 列具有实际数据，因此我们应该更改代码以使用 valuenum

我来看下更改后的结果：


-- begin query that extracts the data
SELECTMAX(subject_id) AS subject_id, MAX(hadm_id) AS hadm_id, MAX(charttime) AS charttime, le.specimen_id-- convert from itemid into a meaningful column-- 从 itemid 转换为有意义的列, MAX(CASE WHEN itemid = 51003 THEN valuenum ELSE NULL END) AS troponin_t -- 肌钙蛋白t, MAX(CASE WHEN itemid = 50911 THEN valuenum ELSE NULL END) AS ck_mb  -- 肌酸激酶同工酶,是CK中的一部分, MAX(CASE WHEN itemid = 50963 THEN valuenum ELSE NULL END) AS ntprobnp -- 氨基末端脑利钠肽前体,实际是BNP前体降解后的化学结构之一,可以理解为BNP的代谢产物，该项检查主要用于心脑血管疾病中,用于评估病情
INTO work.cardiac_marker_fixed
FROM mimiciv_hosp.labevents le
WHERE le.itemid IN(-- 51002, -- Troponin I (troponin-I is not measured in MIMIC-IV)-- 52598, -- Troponin I, point of care, rare/poor quality51003 -- Troponin T, 50911  -- Creatinine Kinase, MB isoenzyme, 50963 -- N-terminal (NT)-pro hormone BNP (NT-proBNP) )AND valuenum IS NOT NULL
GROUP BY le.specimen_id
;