《Nature》创新技术发现环境变化影响活细胞的RNA形状

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来源:生物通

通过创新技术,揭示了环境条件对活细胞中RNA动态结构的影响。

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这项研究是Dame Caroline Dean FRS教授和Yiliang Ding博士团队合作的结果,增加了我们对细胞水平对环境信号的反应的理解。这增加了我们利用这些知识来微调作物或开发基于RNA的治疗方法的可能性,如COVID-19 (SARS-COV-2)。

这些研究小组之前的研究表明,两个重要的遗传元素COOLAIR和FLC相互作用,调节植物对冷暖的分子反应。但COOLAIR的RNA结构如何参与调控植物开花的基因刹车FLC,目前尚不清楚。在基因表达过程中,DNA被转录成RNA,然后RNA被用来制造蛋白质。RNA通常被称为“细分子”,因为它是单链的,但最近的工作强调了它的结构多样性,以及这些结构如何影响基因调控和蛋白质合成。在植物中,FLC起着阻止开花的作用,它是一种分子机制的关键部分,确保植物只有在达到所需的低温暴露水平时才开花。COOLAIR与FLC反义,在低温暴露后与FLC结合并阻止其转录。了解这些机制将是理解气候变化后果的关键。

小组的研究人员开发了一项新技术,能够在活细胞中单个分子的分辨率上分析RNA结构。利用这项技术,他们可以观察到RNA结构的变化。在温暖的条件下,COOLAIR RNA采用三种主要结构,这些形状和比例在植物暴露在低温后发生了变化。他们注意到,在COOLAIR的一个高可变区域,RNA构象的改变改变了FLC的表达。通过在这个RNA区域的序列中引入突变,研究人员能够改变植物的开花时间。

Ding博士说:“我们的工作表明,RNA可以采用不同的构象或结构。这些不同的构象会随着外界条件的变化而发生动态变化。在这项研究中,通过调整RNA结构,我们改变了植物的开花时间。”

了解RNA结构如何影响RNA功能,以及在RNA细胞水平上改造植物基因组的能力,增加了设计具有更理想农艺和营养性状的作物类型的可能性。该组织表示,这项技术也可以应用于人类细胞,其中RNA结构可以作为设计基于RNA疗法的指南。

第一作者Pan Zhu博士说:“每一种RNA都可能有自己的RNA结构景观和构象多样性。我们的技术将使我们能够探索相关RNA(如SARS-COV-2)中RNA结构的普遍功能重要性。”

该小组现在将寻求与基于RNA的工业或学术合作者分享他们的新技术。

参考文献

In vivo single-molecule analysis reveals COOLAIR RNA structural diversity

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