图谱实战 | 医学知识图谱的价值与应用场景

转载公众号 | OMAHA联盟


随着技术的进步和市场的逐渐成熟,人工智能在医疗等领域的应用日益广泛和深入。而知识图谱技术作为一种从海量文本和图像中抽取结构化知识的手段,正在成为推动人工智能发展的核心驱动力之一。

  ◆  ◆

知识图谱概述

知识图谱是一种用图模型来描述知识和建模世界万物之间的关联关系的技术方法,由节点和边组成,节点表示实体(entity)、概念(concept)或属性值(value);边表示实体的属性(property)或实体间的关系(relation),三元组是知识图谱的基本表示形式。在逻辑上可将知识图谱分为模式层和数据层,模式层一般指Schema,是知识图谱的概念模型和逻辑基础,是数据层的规范约束;数据层主要由一系列的事实组成,主要基于模式层定义的模型构建数据,以三元组形式存储。以二甲双胍为例,其部分知识图谱示例如图1。

c43164d3ef0c01524feae781ffa10e4e.png

图1 二甲双胍部分知识图谱示例

知识图谱按领域可分为通用知识图谱和领域知识图谱,医学知识图谱是一种重要的领域知识图谱,它在语义搜索、知识问答和临床决策支持等智慧医疗领域都有很好的发展前景。

  ◆  ◆

医学知识图谱的应用场景

1. 语义搜索。语义搜索不拘泥于用户所输入请求语句的字面本身,而是透过现象看本质,准确地捕捉到用户所输入语句后面的真正搜索意图,从而更准确地返回最符合用户需求的搜索结果。将知识图谱应用于搜索是当前实现语义搜索的有效解决方案,知识图谱描述了事物的分类、属性和关系,具有丰富的语义信息,可以为语义搜索提供极大的底层支持。基于医学知识图谱的语义搜索目前被用于医学百科知识、临床指南/文献、医学健康资讯、医疗保健信息等内容的推荐。

2. 知识问答。基于知识库的问答(Knowledge-Based Question Answering,KBQA)也称知识问答,主要依托于大型的知识库,将用户的自然语言问题转化成结构化查询语句,直接从知识库中导出用户所需的答案。KBQA已经成为各种智能问答系统的标准组件配置,知识图谱由于具有知识丰富、结构化程度高和易于推理等特点,是KBQA的知识库中最重要组成部分之一。

医学知识较其他领域相比专业性更高,非专业人士很难通过自主理解一堆资源文档,来精准地找到相关问题的答案。因此,基于医学知识图谱的KBQA可以帮助患者更加快捷、便利地获得问题的答案,适用于医学知识科普、智能导诊、自诊等领域。

3. 临床决策支持。临床决策支持(Clinical Decision Support,CDS)是指运用相关的、系统的临床知识和患者基本信息及病情信息,向临床医务工作者提供加强医疗相关的决策和行动的信息,提高医疗质量和医疗服务水平。具有临床决策支持功能的系统,称为临床决策支持系统(Clinical Decision Support System,CDSS),一般由知识库、推理机和人机交互接口三个部分组成,其中知识库是核心。

医学知识图谱中包含丰富的医学基础知识,可以作为CDSS知识库中的重要组成部分,它为CDSS的推荐结果提供了可解释的依据,能够协助系统从辅助诊断、治疗方案推荐、合理用药检测等方面为临床医务人员提供决策支持。

随着技术和行业的发展,目前知识图谱也被应用于辅助药物研发、公共卫生事件的预警场景中。

1. 药物研发。近年来,人工智能辅助药物研发逐渐成为研究的热点。知识图谱可应用于药物研发的知识的聚类分析,帮助提出新的可以被验证的假说,从而加速药物研发的过程,降低研发成本。

2. 公关卫生事件应对。在流行病学调查和疫情发生事件的分析和预警等公共卫生事件场景中,知识图谱采用图存储数据的理念可以起到非常大的帮助。例如,利用知识图谱的形式可以直观地表示流行病调查中的人员分布、人员活动轨迹、发病时间等信息,基于图展示出的信息可以更方便的用于病例之间相关性的分析,更快地分析和梳理出感染源头。另外,对疫情发生事件的脉络进行分析,通过找到多个事件存在的因果关系,构建疫情相关事件知识图谱,帮助发现潜在的公共威胁,从源头上预防和降低舆情风险。

  ◆  ◆

“汇知”医学知识图谱

“汇知”医学知识图谱(Wisdomed Medical Knowledge Graph,简称“汇知”图谱)致力于建立符合中文环境下的规范、共享、易用、动态、系统的医学知识图谱。以满足临床智慧诊疗的知识应用需求为切入点,围绕“诊前-诊中-诊后”流程开展疾病、药品、检验检查、手术操作四大细分领域知识图谱构建,为医疗领域提供广泛的知识支撑。

1 | “汇知”图谱的构建

“汇知”图谱基于临床指南、临床路径、药品说明书、医学书籍和医学文献等高质量医学资源,采用机器+人工方式进行构建,专家全流程参与,严格把关数据质量,真实还原医学知识。同时,“汇知”图谱与“七巧板”术语集建立映射关系,实现数据的标准化,从而促进知识更深度地应用。

33ae86364f26101a9f7ad5e6176ecd45.png

图2 “汇知”图谱总体架构

2 | “汇知”图谱资源

“汇知”图谱根据不同领域划分,可分为疾病、药品、手术操作和检验检查四大知识图谱。目前已发布疾病和药品知识图谱,共计11.7万实体、91.4万三元组,后续将发布手术操作和检验检查知识图谱。

■  疾病知识图谱:以疾病为中心,链接超过3万种疾病的临床表现、科室、相关检查、治疗方式、症状等核心关系。共包含7.5万实体,34.5万三元组。为辅助诊疗、知识问答等系统的研发提供高质量、结构化知识库基础,助力疾病诊疗水平的提升。

■  药品知识图谱:以药品为中心,链接超过2.3万种药品的适应证、适用人群、禁忌证、禁忌人群等核心关系,共包含4.8万实体,59.0万三元组。为助力临床合理用药等场景提供可靠的智能引擎。

5c0218228aaa04ef88d2946bd2f50231.png

图3 “汇知”医学知识图谱示例

3 | “汇知”图谱获取方式

感兴趣的读者可以登录HiTA知识服务平台(hita.omaha.org.cn)下载知识图谱样例数据体验,也可以加入OMAHA获取全量“汇知”图谱资源。

dbb1caae3becfee0c2fb003d8b3b5c1f.png

(“汇知”图谱资源)

bce48f9166658b6c76c3c6f25f2a2096.png

(样例数据)

注:部分内容节选自《imit白皮书第二十二期发布:医学知识图谱:医学人工智能的基石》


OpenKG

OpenKG(中文开放知识图谱)旨在推动以中文为核心的知识图谱数据的开放、互联及众包,并促进知识图谱算法、工具及平台的开源开放。

d37a3942a615d08d02a0825f07a4df50.png

点击阅读原文,进入 OpenKG 网站。

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处:http://www.mzph.cn/news/477765.shtml

如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请联系多彩编程网进行投诉反馈email:809451989@qq.com,一经查实,立即删除!

相关文章

Spring Cloud Alibaba基础教程:Sentinel Dashboard中修改规则同步到Nacos

上一篇我们介绍了如何通过改造Sentinel Dashboard来实现修改规则之后自动同步到Apollo。下面通过这篇,详细介绍当使用Nacos作为配置中心之后,如何实现Sentinel Dashboard中修改规则同步到Nacos。关于下面改造的原理和分析可以见上一篇《Sentinel Dashboa…

OCR完整技术栈10天掌握!教程完全开源,更有产学研大佬们联合授课!

你日常会用到OCR(光学字符识别)技术吗?“妈妈再也不用担心我的学习了”、“老板来问进度了,文献还没整”... ...除了点读机广告,很多人对OCR的印象主要是肝文章的时候被OCR“救过命”,这项技术最早也是被用…

论文浅尝 - ACL2022 | 基于多语言语义解耦表示的跨语言迁移方法实现多语言阅读理解...

论文作者:吴林娟,天津大学,研究方向为自然语言理解论文链接:http://arxiv.org/abs/2204.00996代码地址:https://github.com/wulinjuan/SSDM_MRC摘要多语言预训练模型在机器阅读理解(Machine Reading Comprehension, MR…

LeetCode 1017. 负二进制转换(负数进制转换)

1. 题目 给出数字 N,返回由若干 “0” 和 "1"组成的字符串,该字符串为 N 的负二进制(base -2)表示。 除非字符串就是 “0”,否则返回的字符串中不能含有前导零。 示例 1: 输入:2 输…

公益:开放一台Nacos服务端给各位Spring Cloud爱好者

之前开放过一台公益Eureka Server给大家,以方便大家在阅读我博客中教程时候做实验。由于目前在连载Spring Cloud Alibaba,所以对应的也部署了一台Nacos,并且也开放出来,给大家学习测试之用。 Nacos控制台 地址:http:/…

一份北大信科内部流传的 “CS 自救指南”(无广推荐)

文 | PKUFlyingPig,智商掉了一地编 | 小轶小编记:从上周开始,一篇 github 博客就在北大同学的朋友圈之间刷屏。不到一周时间,已收获了 1.8 k stars。这是一篇来自一位北大学弟的博客——“CS自学指南”,一份自学式 cs …

论文浅尝 | Rot-Pro:通过知识图谱嵌入中的投影建模关系的传递性

笔记整理:陈湘楠,浙江大学硕士在读。研究背景知识图嵌入模型学习知识图谱中实体和关系的表示,以预测实体之间的缺失链接(关系)。它们的有效性深受建模和推断不同关系模式(如对称、不对称、逆向、组合和传递…

隐马尔科夫模型(HMM)笔记(公式+代码)

文章目录1. 基本概念1.1 HMM模型定义1.2 盒子和球模型1.3 观测序列生成过程1.4 HMM模型3个基本问题2. 概率计算问题2.1 直接计算法2.2 前向算法2.2.1 前向公式证明2.2.2 盒子和球例子2.2.3 前向算法Python代码2.3 后向算法2.3.1 后向公式证明2.3.2 后向算法Python代码2.4 一些概…

Spring Cloud Alibaba基础教程:Sentinel Dashboard中修改规则同步到Apollo

在之前的两篇教程中我们分别介绍了如何将Sentinel的限流规则存储到Nacos和Apollo中。同时,在文末的思考中,我都指出了这两套整合方案都存在一个不足之处:不论采用什么配置中心,限流规则都只能通过Nacos界面或Apollo界面来完成修改…

中科院科研人员自白:我为什么离开北京

文 | 榴莲EDU源 | 知乎北大本硕博毕业,毕业到中科院北京某所。今年是我工作第三年,年前刚刚调动了工作,转战南京某高校。为什么?细说起来一大堆,总结起来就两个字:房子。上学的时候不了解墙外的世界&#x…

评测通知 | 2022年全国知识图谱与语义计算大会评测任务发布

一、任务简介CCKS技术评测旨在为研究人员提供测试知识图谱与语义计算技术、算法、及系统的平台和资源,促进国内知识图谱领域的技术发展,以及学术成果与产业需求的融合和对接。去年,CCKS 2021评测竞赛环节共设立了5个主题共计14个任务&#xf…

Spring Cloud Alibaba基础教程版本升级:0.2.1-gt;0.2.2

最近Spring Cloud Alibaba发布了最新版本,其中包含了一些比较重要的内容,比如:Nacos 1.0.0支持,Dubbo的支持等。所以把之前的系列文章中内容以及代码案例都做了升级,其中包括: Spring Cloud Alibaba 从 0.…

Google掀桌了,GLUE基准的时代终于过去了?

文 | Severus大家好,我是Severus,一个在某厂做中文文本理解的老程序员。今年11月,Google 在 NeurIPS2021 投稿了一篇文章,名为 AI and the Everything in the Whole Wide World Benchmark,矛头直指评估AI模型“通用”能…

技术动态 | W3C计划成立RDF-star工作组

转载公众号 | W3C资讯W3C 计划成立 RDF-star 工作组,现开始筹备小组工作章程,界定标准化范畴及工作模式。详情参见以下章程草案:https://w3c.github.io/rdf-star-wg-charter/RDF-star(最初拼写为 RDF*)是 RDF 的一种扩…

LeetCode 1282. 用户分组(桶排序思想)

1. 题目 有 n 位用户参加活动,他们的 ID 从 0 到 n - 1,每位用户都 恰好 属于某一用户组。给你一个长度为 n 的数组 groupSizes,其中包含每位用户所处的用户组的大小,请你返回用户分组情况(存在的用户组以及每个组中用…

Spring Cloud Alibaba 新版本发布:众多期待内容整合打包加入!

在Nacos 1.0.0 Release之后,Spring Cloud Alibaba也终于发布了最新的版本。该版本距离上一次发布,过去了整整4个月!下面就随我一起看看,这个大家期待已久的版本都有哪些内容值得我们关注。 版本变化 之前在《Spring Cloud Aliba…

MSRA-万字综述 直击多模态文档理解

文 | 付奶茶随着最近几年多模态大火的,越来越多的任务都被推陈出新为多模态版本。譬如,传统对话任务,推出了考虑视觉信息的多模态数据集;事件抽取,也推出视频形式的多模态版本;就连 grammar induction&…

LeetCode 991. 坏了的计算器(逆向思考)

1. 题目 在显示着数字的坏计算器上,我们可以执行以下两种操作: 双倍(Double):将显示屏上的数字乘 2;递减(Decrement):将显示屏上的数字减 1 。 最初,计算器…

Spring Cloud Alibaba基础教程:Sentinel使用Apollo存储规则

上一篇我们介绍了如何通过Nacos的配置功能来存储限流规则。Apollo是国内用户非常多的配置中心,所以,今天我们继续说说Spring Cloud Alibaba Sentinel中如何将流控规则存储在Apollo中。 使用Apollo存储限流规则 Sentinel自身就支持了多种不同的数据源来…

评测 | CCKS2022-面向数字商务的知识图谱比赛重磅上线,奖金等你来拿!

转载公众号 | 夕小瑶的卖萌屋CCKS 2022面向数字商务的知识图谱评测赛题介绍阿里巴巴商品数据规模庞大,商品知识图谱为海量异构的商品数据的组织、管理和利用提供了有效的方式。商品数据模态丰富,动态性高,数据存在噪声,这些都对商…