计算药物半抑制浓度IC50的拟合曲线图的做法:
第一步:使用的版本是Graphpad Prism 5,打开软件后,选择XY作图方式:
第二步:将实验所得的数据填写入图表中,注意x轴写入的是log[药物],比如说你加入的药物浓度分别为1-100000nM,那首先你必须先将这个浓度进行换算,一个有效的方法就是在Excel中进行计算,通过log[浓度]获得对于的对数值,如图所示换算为0-5。
第三步:将换算值填入X列,Y列填写你实验所测活性:
第四步:填入数值后,点击左侧date1即可看到如下点状图:
第五步:接下来点击上方analysis栏中中间那个非线性回归曲线,上图红色圈中图标;进入后,可以看到有多种非线性回归曲线方式,由于我们做的是半抑制浓度IC50,因此选择inhibition这一栏,应用后,可以看到图像中出现了一条曲线。
第六步:点击左方的results栏目即可获得此药物的IC50=58.04nM。
此外,也可以用这种方法来做半活化浓度EC50的拟合曲线图。如下图所示填入XY轴数值。
随后同样点击非线性回归曲线
进入后,选择stimulation这一栏,应用后,即可获得活化曲线图。