build

就是将工程src目录的内容全新输出到工程的classes目录下，全面覆盖旧的文件，需要编译的会编译后再输出

clean

就是把workspaces内对应工程的classes目录下的内容全部删除

publish

就是将工程内容全新发布到服务器，将之前的部署文件全部覆盖掉，另外如果将项目从服务器整个移除了，操作publish不会将已移除的项目自动部署到服务器上
publish是发布的意思，其实也就是部署，IDE会判断工程内容是否有变化，有变化则会将最新的部署到服务器，没有变化则不会部署

clean(redeploy)

就是先将已经部署到服务器的项目资料文件全部清空，然后再重新部署，包括jsp、xml、html、jar包等文件重新部署
其实这个redeploy和publish功能基本一样，唯一的区别就是IDE会先判断工程内容是否有变化，有变化执行publish才有作用，否则不会执行。而redeploy则不需要判断内容是否有变化，操作redeploy直接将服务器旧的工程内容清空再重新部署
所以对于MyEclipse而言，部署翻译成英文就是publish或者deploy

新增了java文件或者修改了已有的java文件

如果MyEclipse没有设置自动build，你要先build项目，然后再publish到服务器就可以了

删除了java文件或者包

要不要先clean，再build项目才行？我实际操作过，其实并不需要，直接build project就可以了，因此clean这个功能是在什么情况下使用，估计是IDE有时候出错，并没有将多余的文件彻底清除掉时，才需要操作clean，正常情况下没有必要操作clean

修改了classes目录以外的文件

其实就是src以外的文件，通常是WebRoot目录下的文件，那么就和clean、build没有关系了，只要选中你要运行的项目，操作redeploy或者publish，修改的文件才能部署过去，而且是全面覆盖旧的文件