数据结构---KMP模式匹配病毒感染人的DNA检测

数据结构—KMP模式匹配病毒感染人的DNA检测

原理：参考趣学数据结构

代码：

#include<stdio.h>
#include<stdlib.h>
#define N 100
int next[N];
void getNext(char *T, int *next, int m) {//求解当前字符前面的最大公共前缀和后缀int j = 1, k = 0;next[j] = 0;//从1开始计算while (j <= m) {if (k == 0 || T[k] == T[j]) {//从下标0开始计算++j;++k;if (T[k] == T[j]) {//改进的更新next数组的方法，减少不必要的回退next[j] = next[k];//没比较的可能}else {//也就是只有不相等的时候才有比较的可能next[j]=k;//与当前k位置的字符比较}}else {k = next[k];//回退查找前面的最大公共前缀和后缀}}printf("next数组值:");for (int i = 1; i <= m; i++) {printf("%d ", next[i]);}printf("\n");
}
int KMP(char * S, char* T, int pos, int n, int m) {//KMP算法进行模式匹配int i = pos, j = 1;while (i <= n&& j <= m) {//不能在这里使用i<=n-m+1,否则可能会破坏（截断)匹配成功if (i > n - m + 1 && j == 1) {break;//再减少一点比较的次数}if (j == 0 || S[i] == T[j]) {i++;j++;}else {j = next[j];//根据最大公共前缀和后缀计算的next数组，j回退而i不回退}}//printf("\n---  %d ---\n", j);if (j ==m+1) {//返回查找成功子串的初始位置 ==不能写成=   写>更安全printf("查找成功子串的初始位置为:%d\n", i - j);return i - j;}printf("查找子串失败！\n");return -1;
}
void haveAffectionV(char *S,char* T,int n,int m) {//检查人的DNA是否被病毒的变种感染char TT[10];//存储病毒的变种 m个变种,不采用二倍线性扩展变种，使用循环取余变种for (int i = 0; i <= m-1; i++) {//移动的步数for (int j = 1; j <= m; j++) {if (i + j <= m) {TT[j] = T[i + j];}else {//对循环重新开始的数取%(m+1)再加1对应下标的字符TT[j] = T[(i + j) % (m + 1)+1];}}for (int k = 1; k <= n; k++) {//遍历主串printf("%c", S[k]);}printf("\n");for (int k = 1; k <= m; k++) {//遍历子串printf("%c", TT[k]);}printf("\n");getNext(TT, next, m);//计算next数组（最大公共前缀和后缀长度）printf("\n");KMP(S, TT, 1, n, m);//模式匹配printf("\n");}
}
int main() {char S[18] = "-adecadecadcbadcb";char T[10] = "-adecadcb";//'\0'字符串结束的标识haveAffectionV(S, T, 16, 8);system("pause");return 0;
}