h5 hdf5 pytables 数据库 减少空间占用的方法

方法来源:https://forum.hdfgroup.org/t/hdf5-deleting-datasets-and-recovering-space/1293

h5 数据库,在删除一些数据,表,数组后,无法变小;
或是在多次读写后,会越来越大,并且有一些空间会永久无法重用,导致浪费。

此时可以使用 h5repack 工具,快速重建 h5 数据库,可以立刻把未使用空间省出来。
也可以同时使用无损压缩,进一步减少 h5数据库的空间占用。

重建 h5 数据库的命令

h5repack old.hdf5 new.hdf5

重建 h5 数据库时,同时使用 gzip 进行压缩

h5repack -f GZIP=1 .\tmp_db.hdf5 new.hdf5

h5repack 命令的来源
在hdf5 的官方下载页面 https://portal.hdfgroup.org/downloads/index.html 点击这个
在这里插入图片描述
在这里找到预构建的安装程序
在这里插入图片描述
我的是windows系统,所以选中 windows 系统
在这里插入图片描述
然后选择这个在这里插入图片描述
直接安装之后,重启系统,即可有 h5repack 命令

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