MyISAM和InnoDB是MySQL数据库中两种常用的存储引擎。它们在功能和性能方面有一些区别，下面是它们的主要区别：

1. 事务支持：InnoDB是一个支持事务处理的存储引擎，而MyISAM不支持事务。事务是一组数据库操作，可以一起成功或者一起失败，确保了数据的一致性和完整性。

2. 锁定级别：InnoDB使用行级锁定（row-level locking），可以更好地处理并发操作，提供了更好的性能和并发控制。而MyISAM使用表级锁定（table-level locking），当一个操作对表产生锁时，其他操作必须等待该锁释放才能继续执行。

3. 外键约束：InnoDB支持外键约束，可以在多个相关的表之间建立关系，并通过外键来维护数据的完整性。而MyISAM不支持外键约束，无法强制进行数据完整性的检查。

4. 全文索引：MyISAM支持全文索引，可以实现高效的全文搜索。而InnoDB在MySQL版本5.6之前不支持全文索引，但在之后的版本中也开始支持。

5. 崩溃恢复：InnoDB具有自动崩溃恢复的能力，可以在数据库异常关闭后恢复数据的一致性。MyISAM在崩溃后可能会导致数据不一致，需要进行手动修复。

6. 空间占用：通常情况下，MyISAM的表比InnoDB的表更小，占用更少的磁盘空间。这是因为InnoDB具有额外的功能和元数据来支持事务处理和并发控制。

根据具体的需求和应用场景，选择适合的存储引擎对于数据库的性能和可靠性非常重要。如果需要事务支持、并发控制和数据完整性，建议使用InnoDB。如果需要全文搜索和更小的磁盘空间占用，可以考虑使用MyISAM。