神经影像和人类基因组关联分析的实践过程
- 摘要
- 引言
- 实施步骤
- 1. 阶段1:处理转录图谱数据
- 1.1 步骤1:验证探针到基因的注释
- 1.2 步骤2:过滤探针
- 1.3 步骤3:选择代表性探针
- 1.4 步骤4:将组织样本分配到分块状的大脑区域
- 1.5 步骤5:规范表达测量
- 1.6 步骤6:选择在供体大脑中具有一致表达模式的基因
- 2. 第二阶段:相关表达和神经影像学测量
- 3. 阶段3:评估基因特异性和富集程度
- 4. 结论和前进方向
摘要
现代全脑转录图谱为研究脑组织的分子相关性提供了前所未有的机会，可以使用无创神经成像进行量化。然而，将神经影像学数据与转录组测量相结合并不是直截了当的，需要仔细考虑才能做出有效的推断。在本文中，我们回顾了最近的研究工作，探讨了不同的方法选择如何影响成像转录组学分析的三个主要阶段，包括1)转录图谱数据的处理；2)将转录测量与独立衍生的神经影像学表型
