脚本如下，将下面集合与字段替换成自己的集合名和重复字段名即可。

var removeInstanceIdArr = [];
var data = db.getCollection("table_test").aggregate(
    [
        { 
            "$group" : {
                "key": {"Id": "$instanceId"}, 
                "count": {"$sum": 1},
                "removeArr": {"$addToSet": '$_id'}
            }
        }, 
        {
            "$project" : {
                "Id": "$key.Id", 
                "count": "$count", 
                "removeArr":"$removeArr",
                "key" : 0
            }
        },
        {
            "$match" : {
                "count" : {
                    "$gt": 1