小分子药靶筛选的Pull down实验是一种有效的筛选药物与潜在靶蛋白之间相互作用的体外技术。利用生物分子之间的亲和力原理,将生物素标记的小分子化合物固定在链霉亲和素的磁珠上,与蛋白裂解液进行孵育,孵育结束后与小分子结合的蛋白可以通过质谱检测,将下游的靶点蛋白鉴定出来。该方法简单易行,操作方便,在药靶筛选方面已得到广泛的应用。
丨技术优势
1. 不受结合原理限制,适用范围广
2. 研究方向明确,筛选到的是与研究方向相关的靶点蛋白
3. 鉴定到的靶点蛋白数量较多
4. 可检测到细胞内与小分子结合的靶点蛋白及其互作网络谱
丨经典文章
研究案例1:Pull down +MS筛选苏木酮A的抗炎靶点
2017年7月北京大学屠鹏飞教授团队利用Biotin-SA探针进行Pull down+MS实验“垂钓”苏木酮(SA)的潜在靶点蛋白,发现肌苷单磷酸脱氢酶2(IMPDH2)是SA的关键作用靶点,通过SPR和CETSA实验进一步验证了SA与IMPDH2的直接作用关系,后续通过功能性试验证明了苏木酮A在抗神经炎症方面的作用功效。
研究案例2:Pull down +MS助力揭示天然代谢物促肿瘤的新机制
国家生物医学分析中心南湖实验室满江红/周涛团队利用Pull down +MS技术鉴定代谢物磷酸肌酸在胶质母细胞瘤干细胞中的互作蛋白。研究发现磷酸肌酸通过靶向结合BRD2,抑制其降解,对胶质母细胞瘤干细胞进行表观遗传重编程,最终加速GBM进展的作用机制。本研究帮助我们深入理解胶质母细胞瘤干细胞的代谢特性,也为GBM的治疗提供了新的思路。
丨关于达吉特
上海达吉特药业科技有限公司(简称:达吉特),坐落于上海临港生命健康城产业园,是一家专业开展小分子与药物靶点发现技术的研发与服务的专业性高科技企业。
达吉特核心团队成员由上海中医药大学、上海交通大学和华东理工大学等知名医药院校的药物化学、药理学与系统生物学等跨学科专家组成,致力于为临床前阶段的药物研发提供创新性的技术产品和CRO服务。达吉特的主要业务包含“从药到靶”和“从靶到药”两个方面,涵盖中药/复方活性成分发现、天然化合物库构建、苗头药物筛选、小分子修饰与改造、小分子直接靶点发现与验证等多种业务类型。达吉特正在为创新小分子药物研发和中国的中药现代化提供越来多的助力。
达吉特针对于中药及小分子药物研究,建立了一套完整的技术服务体系:
1)中药/复方的有效成分高精度鉴定;
2)中药有效成分与代谢物组织空间分布
3)小分子化合物批量标记(生物素/炔基/荧光)
4)小分子钓靶(标记法):20K人类蛋白组芯片/ ABPP
5)小分子钓靶(非标记法):DARTS /Lip-MS/ CETSA
6)膜蛋白靶点筛选技术:SPIDER / MPA
7)药物调控通路筛选:磷酸化抗体芯片/磷酸化蛋白组
8)SPR表面等离子共振(分子动力学)
9) 药-靶结合位点分析(高分辨质谱/分子对接)
10) PET-CT与药物分布小动物活体成像
11)天然产物化合物库筛选