免费生物蛋白质的类chatgpt工具助手copilot:小分子、蛋白的折叠、对接

参考:
https://310.ai/copilot

可以通过自然语言通话晚上蛋白质的相关处理:生成序列、折叠等

应该是agent技术调用不同工具实现

  1. 从UniProt数据库中搜索和加载蛋白质。
  2. 使用ESM Fold方法折叠蛋白质。
  3. 使用310.ai基础模型设计新蛋白质。
  4. 使用TM-Align方法比较蛋白质。
  5. 利用ProteinMPNN模型进行蛋白质逆折叠。
  6. 聚焦并可视化蛋白质结构的特定部分。
  7. 生成报告并导出结果。 例如: - 查找结合锌且序列长度小于300的蛋白质。 - 折叠序列"DIHICGICKQQFNNLDAFVAHKQSGCQ"。 - 设计包含特定功能的新蛋白质。 - 比较两个或多个蛋白质。 - 使用ProteinMPNN重新设计蛋白质。 - 高亮显示特定残基范围。 - 导出结果报告。

在线体验:

https://310.ai/copilot

小分子查找
在这里插入图片描述
蛋白质PDB查找
在这里插入图片描述

ProteinMPNN生成蛋白质序列
在这里插入图片描述
ESMFold进行蛋白序列的折叠

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处:http://www.mzph.cn/diannao/19871.shtml

如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请联系多彩编程网进行投诉反馈email:809451989@qq.com,一经查实,立即删除!

相关文章

整合框架(spring...) 统一异常处理

1、 我们想让异常结果也显示为统一的返回结果对象,并且统一处理系统的异常信息,那么需要统一异常处理。 附加:创建封装错误状态码和错误消息VO 代码如下: Result import io.swagger.v3.oas.annotations.media.Schema; impo…

MapDB:轻量级、高性能的Java嵌入式数据库引擎

MapDB:轻量级、高性能的Java嵌入式数据库引擎 在今天的软件开发中,嵌入式数据库因其轻便、高效和易于集成而备受欢迎。对于Java开发者来说,MapDB无疑是一个值得关注的选项。MapDB是一个纯Java编写的嵌入式数据库引擎,它提供了高性…

【手撕面试题】Vue(高频知识点一)

每天10道题,100天后,搞定所有前端面试的高频知识点,加油!!!,在看文章的同时,希望不要直接看答案,先思考一下自己会不会,如果会,自己的答案是什么&…

对于C++STL及其时间复杂度的总结

由于本次在山东CCPC邀请赛中,对于堆的时间复杂度记忆不清晰,导致第4题没有做出来,与铜牌失之交臂,故觉应整理STL的时间复杂度。 本文仅整理有用(竞赛)的stl及其用法,并且不阐述过于基础的内容。…

linux服务器配置GroundingDINO 详细过程

linux服务器配置GroundingDINO 详细过程 1. 参考帖子2. 配置流程:环境配置:py310, cuda118, pytorch2.12.1 设置相关的环境变量:2.2 配置conda下载anaconda 配置相对应的环境 1. 参考帖子 已经跑通了,该踩的坑也都踩过来了&#…

MOE模型入门

一、目录 定义:MOE架构代表类型如何解决expert 平衡的?而不是集中到某一专家。如何训练、微调MOE模型?基础架构优缺点不同MOE 模型实现方式、训练方法 二、实现 定义:MOE架构 MOE:混合专家模型,多个专家共同决策的模…

Redis 探索之旅(进阶)

目录 今日良言:从不缺乏从头开始的勇气 一、持久化 1、RDB 2、AOF 二、Redis 的事务 三、主从复制 四、哨兵模式 五、集群模式 六、缓存 七、分布式锁 今日良言:从不缺乏从头开始的勇气 一、持久化 持久化就是把数据存储在硬盘上,无…

SQL 入门:使用 MySQL 进行数据库操作

SQL 入门:使用 MySQL 进行数据库操作 目录 引言SQL 基础 SQL 语言概述MySQL 简介 数据库设计基础 数据库与表的设计常见数据类型 MySQL 安装与配置 安装 MySQL基本配置与连接 基本 SQL 语句 数据库的创建与删除表的创建、修改与删除数据插入、更新与删除 数据查询…

CUDA学习(2)

什么是CUDA CUDA(Compute Unified Device Architecture),统一计算设备架构,英伟达推出的基于其GPU的通用高性能计算平台和编程模型。 借助CUDA,开发者可以充分利用英伟达GPU的强大计算能力加速各种计算任务。 软件生…

保险 - day12 时序数据库influxdb

时序数据库 时序数据库是近几年一个新的概念,与传统的Mysql关系型数据库相比,它的最大的特点是:数据按照时间顺序存储。举例来说,日志数据,是以时间顺序存储的,所以用时序数据库存储是一种很好的选择。使用…

【stm32】stm32f407 ch340下载

一、接线 1、ch340 Vcc短接3v3 5v---------5v GND-----GND TX ------RX RX --------TX 2、stm32F407 如上图,我们需要进入isp下载模式,接线图如下 二、下载 使用FlyMcu选择你要下载的程序文件中的.hex文件, 然后配置图如下&#xff1…

Visual Studio的桌面快捷方式图标不显示

1.问题描述 以下以Visual Studio 2019举例, 正常图标: 但是当前Visual Studio的桌面快捷方式图标不显示了? 2.问题原因分析 Visual Studio 2019桌面快捷方式图标不显示可能由以下几个原因造成: 图标缓存问题:Windo…

解析《动物园规则怪谈》【逻辑】

鉴赏《动物园规则怪谈》【逻辑】 前言版权推荐鉴赏《动物园规则怪谈》推理游客正方“它”方其他物品 不同规则或纸条的对比联系出现的地方及联系游客入园历程:被“它”污染的过程鉴赏升华 最后 前言 2024-5-31 13:05:38 以下内容源自《【逻辑】》 仅供学习交流使用…

rnn 和lstm源码学习笔记

目录 rnn学习笔记 lstm学习笔记 rnn学习笔记 import torchdef rnn(inputs, state, params):# inputs的形状: (时间步数量, 批次大小, 词表大小)W_xh, W_hh, b_h, W_hq, b_q paramsH stateoutputs []# 遍历每个时间步for X in inputs:# 计算隐藏状态 HH torch.tanh(torch.…

五种主流数据库:常用数据类型

在设计数据库的表结构时,我们需要明确表中包含哪些字段以及字段的数据类型。字段的数据类型定义了该字段能够存储的数据种类以及支持的操作。 本文将会介绍五种主流数据库中常用的数据类型以及如何选择合适的数据类型,包括 MySQL、Oracle、SQL Server、…

【Linux】从零开始认识进程间通信 —— 共享内存

送给大家一句话: 吃苦受难绝不是乐事一桩,但是如果您恰好陷入困境,我很想告诉您:“尽管眼前十分困难,可日后这段经历说不定就会开花结果。”请您这样换位思考、奋力前行。 -- 村上春树 🔆🔆&…

[数据集][目标检测]打架检测数据集VOC格式3146张2类别

数据集格式:Pascal VOC格式(不包含分割的txt文件,仅仅包含jpg图片和对应的xml) 图片数量(jpg文件个数):3146 标注数量(xml文件个数):3146 标注类别数:2 标注类别名称:["nofight","fight"] 每个类别…

c# - 运算符 << 不能应用于 long 和 long 类型的操作数

Compiler Error CS0019 c# - 运算符 << 不能应用于 long 和 long 类型的操作数 处理方法 特此记录 anlog 2024年5月30日

PBR系列-物理材质(上)

作者&#xff1a;游梦 对PBR系列文章感兴趣还可以看前文&#xff1a; PBR系列 - 物理光源 PBR系列-光之简史 前面两篇文章分别介绍了物理光源与光学研究简史&#xff0c;在对光有了简单认识之后&#xff0c;再认识物理材质会发现其实本质上还是对光的研究&#xff0c;再深入…

python爬取每日天气情况

python爬取每日天气情况 一、项目简介二、完整代码一、项目简介 本次爬取的目标数据来源于天气网,数据所在的页面如下图所示,本次任务较为简单,按照正常操作流程操作即可,即抓包分析数据接口,发送请求获取数据,解析数据并持久化存储。发送请求使用requests库,解析数据使…