在linux上安装r-base和rpy2到conda环境

安装r-base(国外,可能需要很久>5min,或者需要多次尝试)

conda install r-base

安装rpy2

pip install rpy2

在r-base下安装R包

在命令行输入R进入R语言环境,安装其他R包

R
install.packages("mclust")

安装完成后退出R环境:

q()

可能的报错

1.安装R包失败--安装“xxx”时退出状态的值不是0

解决方案:安装更新版本的r-base

2.r-base,rpy2,numpy版本直接的不兼容可能导致额外的错误

可用的版本搭配如下

# Name                    Version            
r-base                    4.1.0              
rpy2                      3.5.0              
scanpy                    1.10.3             
torch                     2.4.0     
numpy                     1.24.4

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