科研绘图系列:R语言富集散点图(enrichment scatter plot)

在这里插入图片描述

介绍

富集通路散点图(Enrichment Pathway Scatter Plot)是一种数据可视化工具,用于展示基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis, GSEA)的结果。

横坐标是对应基因名称,纵坐标是通路名称,图中的点表示该基因在某个通路下的qvalue,可以简单理解为不同环境下的贡献大小。

加载R包

导入所需要的R包,在导入前需要用户自己安装。

library(readxl)
library(tidyverse)
library(reshape2)# rm(list = ls())
options(stringsAsFactors = F)
options(future.globals.maxSize = 1000 * 1024^2)

导入数据

数据可从以下链接下载(画图所需要的所有数据):

  • 百度云盘链接: https://pan.baidu.com/

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