single_cell_tutorial 教程

介绍

1、AnnData 不是一个单一的表格,而是一个包含多个表格和矩阵的复杂数据结构,用于处理和存储单细胞基因组数据。

AnnData对象包含以下主要部分:

  1. var:基因的元数据(Pandas DataFrame格式),包含每个基因的属性信息。例如每个基因的ID、名称、染色体位置等。可以将其看作是基因(列)的属性数据。
  2. obsp:细胞之间的对称关系矩阵(通常是稀疏矩阵)。
  3. obsm:细胞的多维数据矩阵(Pandas DataFrame格式),如降维结果。
  4. X:核心数据矩阵,通常是细胞(行)和基因(列)的表达计数矩阵。
  5. obs:细胞的元数据(Pandas DataFrame格式),包含每个细胞的属性信息。每个细胞的类型、状态、处理条件。可以将其看作是细胞(行)的属性数据。
  6. layers:不同类型的计数矩阵(字典格式),如归一化后的计数矩阵、原始计数矩阵等。

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处:http://www.mzph.cn/bicheng/34233.shtml

如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请联系多彩编程网进行投诉反馈email:809451989@qq.com,一经查实,立即删除!

相关文章

软件工程-第4章结构化编码和测试

软件的实现阶段:软件编码,单元测试和综合测试。 软件编码是对软件设计的进一步具体化,其任务是将设计表示变换成用程序设计语言编写的程序。 软件测试是软件质量保证的重要手段,要成功开发出高质量的软件产品,必须认…

如何使用 NFTScan NFT API 在 Sei 网络上开发 Web3 应用

Sei Network 是一个专为交易而设计的 Layer 1 区块链。它建立在 Cosmos SDK 上,使用一种称为 Tendermint BFT 的新型共识机制。不仅专攻 DeFi 领域的加密资产交易,更在游戏、社交媒体和 NFTs 等热门 verticals 构建了多功能区块链生态系统。Sei Network …

Day15—热点搜索词统计

一、要求 根据用户上网的搜索记录对每天的热点搜索词进行统计,以了解用户所关心的热点话题。 要求完成:统计每天搜索数量前3名的搜索词(同一天中同一用户多次搜索同一个搜索词视为1次)。 二、数据 三、配置scala环境 1.下载sca…

网站制作和推广

在当今数字化时代,拥有一个网站对于企业的发展和推广来说是至关重要的。网站既可以作为一个企业的形象展示,也可以作为一个销售渠道,更可以作为一个品牌传播的平台。在本文中,我们将讨论网站制作和推广的重要性,以及一…

08较成功的降低干扰获得较好的波形

08较成功的降低干扰获得较好的波形 波形数据当前数据调整后的数据后续 结语其他以下是废话 试验,本身就是一个摸索的过程,在上一阶段的试验中,我们优化了采集装置,更换了导电性较好的电极。 目前数据美观程度较之前提升了不少&…

ViT:3 Compact Architecture

大模型技术论文不断,每个月总会新增上千篇。本专栏精选论文重点解读,主题还是围绕着行业实践和工程量产。若在某个环节出现卡点,可以回到大模型必备腔调或者LLM背后的基础模型重新阅读。而最新科技(Mamba,xLSTM,KAN)则…

动手学深度学习(Pytorch版)代码实践 -卷积神经网络-27含并行连结的网络GoogLeNet

27含并行连结的网络GoogLeNet import torch from torch import nn from torch.nn import functional as F import liliPytorch as lp import matplotlib.pyplot as pltclass Inception(nn.Module):# c1--c4是每条路径的输出通道数def __init__(self, in_channels, c1, c2, c3, …

【kaggle数据集无法下载解决办法】

kaggle数据集无法下载的解决办法 当我们在做机器学习相关问题的时候,需要到kaggle网站上下载数据集,但是很多时候速度很慢或者连接超时等问题,此时解决办法如下: 在本地安装Kaggle API包 打开终端输入如下指令: pip i…

vscode使用内置插件断点调试vue2项目

1、首先项目中要开启source-map 在vue.config.js 文件中 module.exports {configureWebpack: {devtool: process.env.NODE_ENV ! "production" ? "source-map" : ,} }2、项目根目录新建.vscode/launch.js文件 {"configurations": [{"ty…

解析JavaScript中逻辑运算符和||的返回值机制

本文主要内容:了解逻辑运算符 &&(逻辑与)和 ||(逻辑或)的返回值。 在JavaScript中,逻辑运算符 &&(逻辑与)和 ||(逻辑或)的返回值可能并不总…

GPT-5 一年半后发布?迎接AI技术变革

人工智能的快速发展正在深刻改变我们的世界。作为AI技术的前沿代表,OpenAI的GPT系列一直备受关注。最新消息显示,GPT-5将于一年半后发布,并被期望达到“博士级”的智能水平。GPT-5的到来不仅预示着AI在技术上的飞跃,也意味着它将在…

浏览器提升编译速度小技巧(一)- 防病毒排除

1.引言 在Chrome开发过程中,编译速度是影响开发效率的关键因素之一。编译一个大型项目如Chrome,往往需要处理大量的代码文件和依赖库,这个过程既复杂又耗时。因此,任何能够提升编译速度的技巧,都能显著提高开发效率&a…

Dubbo本地调试解决方案

有三种方式:原文链接 本文尝试使用了原作者推荐的第二种方式,在启动本地的服务时加入全局版本号的参数 -Ddubbo.service.versiontest同时需要修改消费者侧API的版本号。 DubboReference(version "test")private IContentPortraitService contentPortra…

TypeError: Cannot set properties of null (setting ‘innerText‘)?

TypeError: Cannot set properties of null (setting innerText) 解释: 这个错误表明你尝试给一个null值的对象设置innerText属性。在JavaScript中,null表示一个空值或者“没有对象”,因此不能对其进行属性设置操作。 解决方法&#xff1a…

微信小程序的媒体组件

微信小程序中的媒体组件主要包括音频组件 和视频组件 ,它们可以帮助开发者在小程序中嵌入和播放多媒体内容。以下是对这两个组件的详细介绍: 音频组件 组件用于在小程序中播放音频文件。它支持多种配置选项和事件处理。 属性 src: 音频资源的 URL 地址。…

Python-题库篇-基础

文章目录 Python-题库篇-基础题目001: 在Python中如何实现单例模式。题目002:不使用中间变量,交换两个变量a和b的值。题目003:写一个删除列表中重复元素的函数,要求去重后元素相对位置保持不变。题目004:假设你使用的是…

排序题目:丢失的数字

文章目录 题目标题和出处难度题目描述要求示例数据范围进阶 解法一思路和算法代码复杂度分析 解法二思路和算法代码复杂度分析 解法三思路和算法代码复杂度分析 解法四思路和算法代码复杂度分析 解法五预备知识思路和算法代码复杂度分析 题目 标题和出处 标题:丢失…

osg::Stats类用法及该类源码剖析

1. 概述 Stats是英文单词statistics的简写。顾名思义,就知道osg::Stats是osg中用来统计某些信息的类,如:帧率等,在osg中很多地方用到该类统计某些信息,如下代码是摘自osg的Viewer::eventTraversal()函数,该…

CentOS7.6安装RabbitMQ

前言:因为RabbitMQ是ERlang语言编写所以要先安装ERlang再安装RabbitMQ 安装ERlang 借鉴前辈原文地址:https://www.cnblogs.com/fengyumeng/p/11133924.html 第一步:安装依赖 yum -y install gcc glibc-devel make ncurses-devel open…

快速上手 Spring Boot:基础使用详解

快速上手 Spring Boot:基础使用详解 文章目录 快速上手 Spring Boot:基础使用详解1、什么是SpringBoot2、Springboot快速入门搭建3、SpringBoot起步依赖4、SpringBoot自动配置:以tomcat启动为例5、SpringBoot基础配置6、yaml7、多环境开发配置…